儿童及青少年急性淋巴细胞白血病游离DNA研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07483476

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：急性淋巴细胞白血病（ALL）。微小残留病（MRD）监测是儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）的一个关键预后因素。目前，MRD评估主要依赖于从骨髓穿刺液中获取的细胞DNA。尽管这种方法信息量很大，但也存在局限性，包括需要进行侵入性操作，以及它仅反映骨髓这一区域的情况。肿瘤细胞会将基因组DNA片段释放到血液中，这些片段被称为循环游离DNA（cfDNA）。在实体瘤中，cfDNA分析已成为一种有价值的非侵入性生物标志物，用于疾病监测和治疗反应评估。近期研究表明，在儿童ALL中可检测到cfDNA。本研究旨在探讨血浆cfDNA分析是否能成为基于骨髓的MRD评估的一种替代或补充方法。cfDNA可能更好地反映全身的整体肿瘤负荷，并允许在治疗期间进行更频繁的纵向监测。

主要目标是评估在治疗的两个关键时间点：诱导结束时（第29天）和巩固治疗结束时（第71-78天），血浆cfDNA中检测的MRD与骨髓细胞DNA中检测的MRD之间的相关性。次要目标包括评估外周血细胞DNA与骨髓MRD之间的相关性，描述整个治疗和随访期间使用cfDNA的克隆演变，探索cfDNA与其他生物隔室中检测到的基因组改变的一致性，评估cfDNA MRD对复发风险和事件无生存期的预后价值，以及表征患者与健康对照相比的cfDNA片段组和甲基化组特征。该研究将包括在两个AP-HP儿科血液学中心接受治疗的新诊断ALL儿童和青少年，以及一个由接受HLA分型以进行兄弟姐妹干细胞移植的健康儿童组成的对照组。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。