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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA239382：小鼠急性髓系白血病细胞系克隆的基因组特征（数据集1）

该数据集来自 NCBI，英文名称为“PRJNA239382: Genomic characterization of clones derived from a murine acute myeloid leukemia cell line for the description of genes involved in immunogenicity (dataset 1)”，本站归类为肿瘤 / 白血病。数据集围绕小鼠急性髓系白血病细胞系 C1498 衍生的单细胞克隆展开基因组分析，并与同品系 C57BL/6 小鼠来源的对照 T 淋巴细胞进行比较，主题标签为 Variation。其研究目标在于确定基因缺失和重复对急性髓系白血病细胞免疫原性的影响，整体设计是对源自急性髓系白血病细胞系的小鼠单细胞克隆进行基因组图谱分析，并以同一小鼠品系的对照 T 淋巴细胞作为参照。

【数据集背景】

该数据集的研究背景聚焦于急性髓系白血病细胞的免疫原性。源站描述指出，研究目的是确定基因缺失和重复对急性髓系白血病细胞免疫原性的影响。研究所用的克隆来源于 C1498 AML 细胞系，淋巴细胞则分离自 C57BL/6 小鼠品系。整体设计为对源自急性髓系白血病细胞系的小鼠单细胞克隆进行基因组图谱分析，并与同一小鼠品系的对照 T 淋巴细胞进行比较。这一设计将肿瘤细胞克隆的基因组变异与同品系正常免疫细胞对照并置，用于考察与免疫原性相关的基因。

【数据内容】

数据集的内容围绕小鼠单细胞克隆的基因组图谱展开。克隆由 C1498 AML 细胞系衍生而来，对照样本为同一小鼠品系 C57BL/6 来源的 T 淋巴细胞。研究关注基因缺失和重复这类基因组变异，主题标签为 Variation。数据集英文名称中提及“用于描述参与免疫原性的基因”，说明其内容指向与免疫原性相关的基因层面描述。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件类型或具体基因列表的更多细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。样本材料包括源自 C1498 AML 细胞系的小鼠单细胞克隆，以及从 C57BL/6 小鼠品系分离的淋巴细胞作为对照。整体设计为基因组图谱分析，即对上述克隆与对照 T 淋巴细胞进行比较性的基因组刻画。源站未提供采样时间、具体实验地点、测序方法或数据处理流程的进一步信息。

【适用场景】

基于其研究目标与设计，该数据集适用于考察急性髓系白血病细胞系衍生克隆中基因缺失与重复对免疫原性的影响，也适用于将肿瘤单细胞克隆的基因组特征与同品系对照 T 淋巴细胞进行对比分析。其主题标签 Variation 表明数据可用于基因组变异相关的研究场景。源站未提供关于其他具体应用场景的说明。

【使用方法】

源站未提供关于数据下载、格式、预处理或分析流程的具体使用说明。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、覆盖度、误差或使用限制的具体信息。已知的限定信息为：研究材料为小鼠来源的 C1498 AML 细胞系克隆与 C57BL/6 小鼠 T 淋巴细胞对照，研究目标限于基因缺失和重复对免疫原性的影响。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款的具体信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE55353

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA239382

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的目的是确定基因缺失和重复对急性髓系白血病细胞免疫原性的影响。克隆来源于C1498 AML细胞系。淋巴细胞从C57BL/6小鼠品系中分离。总体设计：对源自急性髓系白血病细胞系的小鼠单细胞克隆与同一小鼠品系的对照T淋巴细胞进行基因组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别