PRJNA239381：小鼠急性髓系白血病细胞系来源克隆的基因组特征分析（数据集2）

该数据集来自 NCBI，聚焦小鼠急性髓系白血病细胞系来源克隆的基因组特征，用于描述与免疫原性相关的基因。研究以 C1498 AML 细胞系衍生克隆为对象，并与同一小鼠品系的对照 T 淋巴细胞进行基因组谱比较，考察基因缺失和重复对白血病细胞免疫原性的影响

sra

基因组分类Variation

PRJNA239381: Genomic characterization of clones derived from a murine acute myeloid leukemia cell line for the description of genes involved in immunogenicity (dataset 2)

基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA239381：小鼠急性髓系白血病细胞系来源克隆的基因组特征分析（数据集2）

该数据集来自 NCBI，英文名称为“PRJNA239381: Genomic characterization of clones derived from a murine acute myeloid leukemia cell line for the description of genes involved in immunogenicity (dataset 2)”，属于肿瘤/白血病分类。其研究目标是确定基因缺失和重复对急性髓系白血病细胞免疫原性的影响。研究对象为源自 C1498 AML 细胞系的小鼠单细胞克隆，并以同一小鼠品系（C57BL/6）分离的对照 T 淋巴细胞作为比较对象，开展基因组谱分析。数据集主题标签为“Variation”，整体围绕小鼠急性髓系白血病细胞系来源克隆的基因组特征展开，用于描述与免疫原性相关的基因。

【数据集背景】

该数据集的研究背景聚焦于急性髓系白血病细胞的免疫原性调控机制。源站描述指出，研究旨在确定基因缺失和重复对急性髓系白血病细胞免疫原性的影响。实验体系基于 C1498 AML 细胞系，该细胞系被用于衍生出多个克隆；同时，淋巴细胞分离自 C57BL/6 小鼠品系，作为对照材料。整体设计为将源自急性髓系白血病细胞系的小鼠单细胞克隆与同一小鼠品系的对照 T 淋巴细胞进行基因组谱比较，从而在基因组层面考察与免疫原性相关的基因变化。

【数据内容】

数据集的内容围绕小鼠单细胞克隆的基因组谱分析展开。研究对象为源自 C1498 AML 细胞系的克隆，对照为同一小鼠品系（C57BL/6）的 T 淋巴细胞。研究关注基因缺失和重复两类基因组变异，并将其与白血病细胞免疫原性的描述相联系。主题标签为“Variation”，表明数据与基因组变异相关。源站描述中提及“dataset 2”，说明该数据集是相关研究数据的一部分。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件类型或具体基因列表的更多细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。生物材料方面，克隆衍生自 C1498 AML 细胞系，淋巴细胞分离自 C57BL/6 小鼠品系。实验设计为对小鼠单细胞克隆进行基因组谱分析，并与同一小鼠品系的对照 T 淋巴细胞进行比较。关于具体的采集时间、测序方法、建库策略及数据处理流程，源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述，该数据集适用于研究基因缺失和重复对急性髓系白血病细胞免疫原性的影响，也可用于比较白血病细胞系来源克隆与对照 T 淋巴细胞之间的基因组谱差异。其主题标签“Variation”表明数据可用于基因组变异相关分析。由于研究对象为小鼠来源材料，该数据集可服务于以小鼠为模型的急性髓系白血病免疫原性研究场景。其他具体应用场景源站未提供。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、分析流程或推荐工具等。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、覆盖度、误差控制或技术限制的说明。该数据集为“dataset 2”，其与相关数据集之间的关系及完整研究范围，源站未提供进一步描述。

【引用与许可】

源站未提供引用方式及许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE55354

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA239381

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的目的是确定基因缺失和重复对急性髓系白血病细胞免疫原性的影响。克隆来源于C1498 AML细胞系。淋巴细胞从C57BL/6小鼠品系中分离。总体设计：对源自急性髓系白血病细胞系的小鼠单细胞克隆与同一小鼠品系的对照T淋巴细胞进行基因组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别