PRJNA1496618：Homo sapiens 蛋白质组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1496618

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了视黄醇X受体α（RXRA）过表达使慢性髓性白血病（CML）细胞对伊马替尼敏感的机制。我们使用Lama84 CML细胞系，通过全蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析，将RXRA过表达细胞与空载体对照进行比较。采用数据非依赖采集（DIA）质谱法，在Orbitrap Fusion Tribrid质谱仪上对每种条件进行生物学三重复检测，原始数据使用DIA-NN（v2.1.0）以无库模式处理。全蛋白质组学鉴定出57,906个前体和6,233种蛋白质，而磷酸化蛋白质组学鉴定出38,818个前体和5,285条磷酸化肽段，对应1,965种蛋白质。差异丰度分析揭示了与RXRA驱动的BCR-ABL1依赖性致癌信号抑制相关的蛋白质和磷酸化事件。该数据集支持一篇多组学论文，该论文提名了CML中RXRA过表达的药理学可操作下游效应因子。对应的ProteomeXchange/PRIDE蛋白质组学数据集：PXD080684

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。