靶向ESR1融合驱动乳腺癌中的激酶组重编程
该数据集来自omicsdi.org,聚焦于ESR1融合驱动的乳腺癌,属于肿瘤/乳腺癌分类。数据基于ER+乳腺癌患者来源异种移植(PDX)肿瘤,采用多重、深度规模的LC-MSMS分析,获取蛋白质组与磷酸化蛋白质组表达谱,并对富集激酶组进行靶向LC-MSMS分析

基本信息
资源简介
靶向ESR1融合驱动乳腺癌中的激酶组重编程
该数据集聚焦于ESR1融合驱动的乳腺癌,属于肿瘤/乳腺癌分类,来源于omicsdi.org。其研究对象为ER+乳腺癌患者来源异种移植(PDX)肿瘤,采用多重、深度规模的LC-MSMS分析,获取蛋白质组与磷酸化蛋白质组表达谱,并对富集激酶组进行靶向LC-MSMS分析。数据集主题标签涵盖LC-MSMS、ESR1融合、乳腺癌、乳腺癌患者来源异种移植肿瘤、蛋白质组和磷酸化蛋白质组。整体而言,该数据集旨在通过蛋白质组与磷酸化蛋白质组层面的深度解析,结合激酶组的靶向检测,为理解ESR1融合驱动乳腺癌的激酶组重编程提供数据支撑。
【数据集背景】
该数据集关注ESR1融合驱动的乳腺癌。ESR1融合是ER+乳腺癌中的一种分子事件,可能驱动肿瘤发生与发展。数据集以ER+乳腺癌患者来源异种移植(PDX)肿瘤为模型,旨在通过蛋白质组与磷酸化蛋白质组分析,结合激酶组靶向分析,探索激酶组重编程现象。其分类归属于肿瘤/乳腺癌,来源站为omicsdi.org。
【数据内容】
数据集包含多重、深度规模的LC-MSMS分析所获得的蛋白质组与磷酸化蛋白质组表达谱,以及针对富集激酶组的靶向LC-MSMS分析数据。主题标签包括LC-MSMS、ESR1融合、乳腺癌、乳腺癌患者来源异种移植(PDX)肿瘤、蛋白质组和磷酸化蛋白质组。这些数据共同构成了对ER+乳腺癌PDX肿瘤在蛋白质组和磷酸化蛋白质组层面的表达谱描述,并特别聚焦于激酶组的靶向检测。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org。样本为ER+乳腺癌患者来源异种移植(PDX)肿瘤。采集方法包括多重、深度规模的LC-MSMS分析,用于蛋白质组和磷酸化蛋白质组表达谱;以及靶向LC-MSMS分析,用于富集激酶组中的激酶检测。源站描述中提及“Multiplexed, deep-scale LC-MSMS analysis for proteome and phosphoproteome expression profile and the targeted LC-MSMS analysis for kinases in enriched kinome of the ER+ breast cancer patient-derived xenograft tumors.”。
【适用场景】
该数据集适用于研究ESR1融合驱动乳腺癌的激酶组重编程,以及ER+乳腺癌PDX肿瘤的蛋白质组与磷酸化蛋白质组表达特征。可用于探索激酶组在肿瘤中的表达变化,或作为蛋白质组与磷酸化蛋白质组分析的参考数据。具体应用场景需结合源站描述及数据本身进一步确定,源站未提供更详细的适用场景说明。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。用户需参考omicsdi.org上该数据集的原始页面或相关文档,以了解数据下载、处理和分析的详细步骤。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量与限制的明确说明。数据基于LC-MSMS技术,其覆盖范围、灵敏度及定量准确性等需依据原始实验设计评估。源站未提供相关评估信息。
【引用与许可】
源站未提供引用与许可信息。用户需访问omicsdi.org上该数据集的原始页面,以获取引用方式和许可条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD036644
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对ER+乳腺癌患者来源异种移植瘤进行多重、深度规模LC-MSMS分析,以获得蛋白质组和磷酸化蛋白质组表达谱,并对其富集激酶组中的激酶进行靶向LC-MSMS分析。
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