基本信息

模态

基因组

任务类型

预测

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

氧化抵抗蛋白1失调促进慢性髓系白血病酪氨酸激酶抑制剂耐药与急变期

PRJNA1186059 数据集来自 NCBI，聚焦 Oxidation Resistance 1（Oxr1）失调与慢性髓性白血病（CML）TKI 耐药及急变期之间的关系。该数据集属于肿瘤/白血病分类，主题标签为 Variation。其研究目标在于揭示 Oxr1、ROS 诱导的遗传改变以及影响 TKI 耐药与 CML 进展的动态过程之间的复杂相互作用。为此，研究开展了高通量测序分析，涵盖 RNA-Seq、全外显子测序（WES）以及 p210 KD 突变检测。该数据集为探索 CML 耐药机制与疾病进展提供了测序层面的数据基础，适用于白血病分子机制与变异相关研究。

【数据集背景】

慢性髓性白血病（CML）的 TKI 耐药与急变期进展是临床与研究关注的重要问题。该数据集围绕 Oxidation Resistance 1（Oxr1）失调展开，旨在解析 Oxr1、ROS 诱导的遗传改变以及影响 TKI 耐药和 CML 进展的动态过程之间的复杂相互作用。数据集以 Variation 为主题标签，说明其关注点涉及遗传变异层面的信息，与研究中 ROS 诱导的遗传改变这一方向相呼应。

【数据内容】

该数据集包含高通量测序分析所产生的数据，具体包括 RNA-Seq、全外显子测序（WES）以及 p210 KD 突变检测三类分析内容。RNA-Seq 用于转录层面的检测，全外显子测序用于外显子区域的变异检测，p210 KD 突变检测则针对 p210 相关突变进行检测。数据集英文名称中标注为 dataset 1，表明其为该研究项目下的第一个数据集。除上述分析类型外，样本数量、数据规模、文件格式等具体信息源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov（NCBI）。其所属项目为 PRJNA1186059，研究主题为 Oxr1 失调促进慢性髓性白血病 TKI 耐药与急变期。数据通过高通量测序分析获得，涵盖 RNA-Seq、WES 与 p210 KD 突变检测。关于样本采集的具体来源、采集时间、采集地点及伦理审批等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤/白血病方向的研究，尤其是围绕 CML 中 TKI 耐药机制与急变期进展的分子研究。可用于分析 Oxr1 失调相关的转录组变化、外显子区域的遗传变异以及 p210 KD 突变情况，进而支持对 Oxr1、ROS 诱导的遗传改变与 TKI 耐药、CML 进展之间相互作用的探索。主题标签 Variation 表明其也可用于变异相关的分析场景。具体适用的分析流程与下游应用，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI 获取，项目编号为 PRJNA1186059。使用时可根据研究目的选择相应的测序数据类型，包括 RNA-Seq、全外显子测序（WES）和 p210 KD 突变检测结果。关于数据下载的具体路径、文件组织方式、预处理步骤及分析工具建议，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于高通量测序分析，包含 RNA-Seq、WES 与 p210 KD 突变检测。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、样本量及批次信息等，源站未提供。使用时应结合具体研究设计加以判断。该数据集标注为 dataset 1，可能为系列数据的一部分，其余部分信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI，项目编号为 PRJNA1186059。关于引用方式、许可条款及使用限制等具体信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281856

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1186059

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为揭示Oxr1、ROS诱导的基因改变以及影响TKI耐药性和CML进展的动态变化之间的复杂相互作用，总体设计：我们进行了高通量测序分析，包括RNA-Seq、全外显子组测序（WES）和p210 KD突变检测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别