整合多参数方法分层慢性粒单核细胞白血病急变期不同表型及其成熟状态与药物敏感性谱

该数据集来自 data.mendeley.com,聚焦慢性粒单核细胞白血病急变期(BP-CMML)。源站描述显示,研究者对 42 例 BP-CMML 的母细胞转录组进行 profiling,发现转录异质性显著且与现有 AML 分类匹配不佳,并呈现静息富集及药物反应特征变异

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2025-01-15 更新
浏览 8
基因组分类肿瘤白血病BP-CMML转录组药物敏感性RandomForest聚类
Dataset - An integrative multiparametric approach stratifies distinct phenotypes of blast phase chronic myelomonocytic leukemia with differential maturation status and drug sensitivity profiles

基本信息

模态
基因组
大小
1.243321798 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2025-01-15
版本
v2

资源简介

整合多参数方法分层慢性粒单核细胞白血病急变期不同表型及其成熟状态与药物敏感性谱

Dataset - An integrative multiparametric approach stratifies distinct phenotypes of blast phase chronic myelomonocytic leukemia with differential maturation status and drug sensitivity profiles

该数据集来自 data.mendeley.com,聚焦慢性粒单核细胞白血病急变期(BP-CMML)。源站描述显示,研究者对 42 例 BP-CMML 的母细胞转录组进行 profiling,发现转录异质性显著且与现有 AML 分类匹配不佳,并呈现静息富集及药物反应特征变异。整合临床、免疫表型和转录组参数后,RandomForest 无监督聚类区分出未成熟与成熟亚型,亚型间在转录模块、癌基因、凋亡调节因子及表面标志表达上存在差异,且对 AML 药物的预测反应不同并在原代样本中体外验证。数据可用于 BP-CMML 表型分层与药物敏感性研究(来源 Mendeley Data)。

【数据集背景】

源站首次发布:2025-01-15。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):约 30% 的慢性粒单核细胞白血病患者会转化为化疗难治性急变期(BP-CMML)。为寻求新的治疗方法,我们对 42 例 BP-CMML 的母细胞转录组进行了分析,观察到广泛的转录异质性,且与当前 AML 分类匹配不佳。BP-CMML 显示出独特的转录组谱,包括静息富集和药物反应特征的变异性。整合临床、免疫表型和转录组参数,RandomForest 无监督聚类区分出未成熟和成熟亚型,其特征是转录模块、癌基因、凋亡调节因子和表面标志物表达模式的差异表达。亚型对 AML 药物的预测反应不同,并在原代样本中进行了体外验证。迭代细化的分层解析出一个分类

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 1.24 GB。数据集 DOI:10.17632/vcsyd7ns8f.2。

【主题与分类】

主题标签:肿瘤、白血病、BP-CMML、转录组、药物敏感性、RandomForest聚类。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/vcsyd7ns8f

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源站:https://data.mendeley.com/datasets/vcsyd7ns8f

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.24 GB。

数据说明

Kristian Gurashi (2025). Dataset - An integrative multiparametric approach stratifies distinct phenotypes of blast phase chronic myelomonocytic leukemia with differential maturation status and drug sensitivity profiles [Dataset]. http://doi.org/10.17632/vcsyd7ns8f.2

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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