相对健康新生儿脐血与胎盘样本及年轻Wilms瘤患者样本的基因研究
该数据集来源于clinicaltrials.gov,聚焦肾癌(Kidney Cancer)研究,包含相对健康新生儿出生队列的脐血与胎盘样本,以及年轻Wilms瘤患者的存档肿瘤组织样本

基本信息
资源简介
相对健康新生儿脐血与胎盘样本及年轻Wilms瘤患者样本的基因研究
该数据集英文名为 Studying Genes Using Cord Blood and Placenta Samples From Relatively Healthy Newborns and Samples From Younger Patients With Wilms Tumor,来源于 clinicaltrials.gov,在站内归入肿瘤 / 肾癌分类,主题标签为 Kidney Cancer。其研究材料包括相对健康新生儿出生队列的脐血与胎盘样本,以及年轻 Wilms 瘤患者的存档肿瘤组织样本,围绕印记基因展开分析。源站描述显示,研究关注出生时脐血与胎盘中印记丢失的发生频率,以及印记基因的 DNA 甲基化水平是否与基因表达存在直接关联。样本将通过聚合酶链反应、焦磷酸测序和实时定量 PCR 等方法进行 DNA 甲基化、单核苷酸多态性和基因表达分析,并尽可能收集样本的性别与年龄信息。整体而言,该数据集连接了出生队列样本与儿童肾脏肿瘤样本,为印记基因相关研究提供材料基础。
【数据集背景】
该数据集对应一项以肾癌为研究条件的项目,英文名称明确指向利用相对健康新生儿的脐血与胎盘样本,以及年轻 Wilms 瘤患者的样本开展基因研究。源站描述列出的研究目标包括两个核心问题:其一,在相对健康的出生队列中,出生时脐血与胎盘样本中印记丢失的频率如何;其二,印记基因的 DNA 甲基化水平是否与基因表达存在直接关联。Wilms 瘤是儿童期肾脏肿瘤的常见类型,将出生时的脐血与胎盘样本同年轻患者的存档肿瘤组织并列研究,有助于在基因印记这一层面上观察出生阶段与肿瘤样本之间的对应关系。该数据集在站内被归入肿瘤 / 肾癌分类,主题标签为 Kidney Cancer,与其研究条件一致。
【数据内容】
数据内容涵盖两类样本:相对健康新生儿出生队列的脐血与胎盘样本,以及年轻 Wilms 瘤患者的存档肿瘤组织样本。针对这些样本,源站描述指出将分析 DNA 甲基化、单核苷酸多态性和基因表达,所采用的技术手段包括聚合酶链反应(PCR)、焦磷酸测序和实时定量 PCR。此外,研究还会尽可能收集样本的性别和年龄信息。源站描述未提供样本数量、队列规模、具体基因位点列表或数据记录条数等细节。
【采集与来源】
该数据集来源于 clinicaltrials.gov,属于登记于该站点的研究项目所涉及的材料与分析内容。样本来源包括相对健康新生儿的脐血与胎盘,以及年轻 Wilms 瘤患者的存档肿瘤组织。源站描述未提供具体的采集时间范围、采集地点、机构名称或样本入库流程等信息。
【适用场景】
基于源站描述,该数据集适用于围绕印记基因开展的研究场景,例如考察出生时脐血与胎盘中印记丢失的频率,以及检验印记基因 DNA 甲基化水平与基因表达之间的关联。由于同时包含相对健康新生儿出生队列样本与年轻 Wilms 瘤患者的存档肿瘤组织样本,也可用于肾癌尤其是儿童肾脏肿瘤相关基因印记问题的探索性分析。源站描述未提及其他具体应用场景。
【使用方法】
源站描述仅说明样本将接受 DNA 甲基化、单核苷酸多态性和基因表达分析,方法包括聚合酶链反应、焦磷酸测序和实时定量 PCR,并尽可能收集性别与年龄信息。源站未提供数据访问方式、文件格式、字段结构或分析流程等使用层面的说明。
【质量与限制】
源站描述中未提供样本量、数据完整性、质控指标或验证结果等信息。可确认的限制性信息是:性别与年龄信息仅在可能的情况下收集,说明部分样本的辅助信息可能不完整。其余质量与限制相关内容源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT01576211
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:肾癌。目标:* 在相对健康的出生队列中,出生时(脐带血和胎盘)印记丢失的频率是多少?* 印记基因的脱氧核糖核酸(DNA)甲基化水平与基因表达有直接关联吗?概要:对存档的肿瘤组织、脐带血和胎盘样本通过聚合酶链反应(PCR)、焦磷酸测序和定量实时PCR进行DNA甲基化、单核苷酸多态性和基因表达分析。如有可能,还收集有关样本性别和年龄的信息。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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