卡波西肉瘤原发患者样本
该数据集是一个基于单细胞RNA测序的卡波西肉瘤原发患者样本数据集，包含来自16名患者的25个皮肤和血液样本的基因表达数据，主要数据模态为单细胞转录组数据。它旨在通过分析KSHV感染细胞群、未感染细胞类型以及肿瘤微环境中的免疫细胞组成，揭示卡波西肉瘤的病理机制，并识别新型生物标志物，用于肿瘤学、病毒学和免疫治疗等研究方向。
基本信息
资源简介
该数据集是一个针对卡波西肉瘤（Kaposi Sarcoma, KS）的单细胞RNA测序数据集。卡波西肉瘤是一种由卡波西肉瘤相关疱疹病毒8型（KSHV）引起的复杂肿瘤。数据集包含来自16名受试者的25个皮肤和血液样本，通过单细胞RNA测序分析，旨在阐明KS肿瘤中受感染和未受感染的细胞类型。研究识别出两个KSHV感染细胞群：一个是CD34阴性的增殖性内皮细胞亚群，另一个是表达内皮基因的CD34阳性细胞，这些细胞存在于多种细胞类型中，如高内皮小静脉、有孔毛细血管和内皮尖端细胞。分析还发现了KSHV感染细胞中的新型细胞生物标志物（如钠通道SCN9A），并揭示KSHV阳性细胞在所有样本中占总肿瘤细胞的比例低于10%，且与肿瘤浸润免疫细胞数量呈负相关。此外，数据集还记录了KS肿瘤在抗逆转录病毒治疗或免疫治疗后细胞组成的变化，以及肿瘤和血液中T细胞受体克隆的扩增情况。该数据集为研究卡波西肉瘤的病理机制、识别预后和预测性生物标志物提供了重要资源，适用于肿瘤学、病毒学和免疫学等研究方向。
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数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/Kaposi_Sarcoma_Primary_Patient_Samples_/28710478
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数据说明
该数据集是一个针对卡波西肉瘤（Kaposi Sarcoma, KS）的单细胞RNA测序数据集。卡波西肉瘤是一种由卡波西肉瘤相关疱疹病毒8型（KSHV）引起的复杂肿瘤。数据集包含来自16名受试者的25个皮肤和血液样本，通过单细胞RNA测序分析，旨在阐明KS肿瘤中受感染和未受感染的细胞类型。研究识别出两个KSHV感染细胞群：一个是CD34阴性的增殖性内皮细胞亚群，另一个是表达内皮基因的CD34阳性细胞，这些细胞存在于多种细胞类型中，如高内皮小静脉、有孔毛细血管和内皮尖端细胞。分析还发现了KSHV感染细胞中的新型细胞生物标志物（如钠通道SCN9A），并揭示KSHV阳性细胞在所有样本中占总肿瘤细胞的比例低于10%，且与肿瘤浸润免疫细胞数量呈负相关。此外，数据集还记录了KS肿瘤在抗逆转录病毒治疗或免疫治疗后细胞组成的变化，以及肿瘤和血液中T细胞受体克隆的扩增情况。该数据集为研究卡波西肉瘤的病理机制、识别预后和预测性生物标志物提供了重要资源，适用于肿瘤学、病毒学和免疫学等研究方向。
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