卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)C5门户顶点结构
该数据集包含卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)C5门户顶点的高分辨率结构数据,数据模态为蛋白质三维结构坐标,通过电子显微镜技术解析,主要用于研究疱疹病毒的衣壳组装、DNA包装机制以及病毒与宿主的相互作用,为抗病毒药物开发和肿瘤病毒学提供结构基础。

基本信息
资源简介
卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)C5门户顶点结构
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Kaposi''s sarcoma-associated herpesvirus (KSHV), C5 portal vertex structure》。
【数据内容】
源站原始描述:genome, portal, capsid, genome packaging, VIRUS, VIRAL PROTEIN
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1016/j.cell.2019.07.035。
【主题与分类】
主题标签:VIRAL PROTEIN。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/6PPB
规范引用:DNA-Packing Portal and Capsid-Associated Tegument Complexes in the Tumor Herpesvirus KSHV. (2019) Cell
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/6ppb
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的病毒粒子结构信息,具体聚焦于其C5对称性门户顶点(portal vertex)的高分辨率结构。数据包含病毒衣壳的顶点组分(如Capsid vertex component 1、Capsid vertex component 2)以及相关的被膜蛋白(如Large tegument protein deneddylase)的结构坐标。这些结构数据通过电子显微镜技术以4.3埃的分辨率解析,并于2019年发布在Protein Data Bank Japan(PDBj)平台。该数据集主要用于研究疱疹病毒的衣壳组装、DNA包装机制以及病毒与宿主相互作用的分子基础,为抗病毒药物设计和肿瘤病毒学研究提供结构生物学依据。
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