肝细胞癌泛素化定量蛋白质组图谱
该数据集是一个包含约12,000个二甘氨酸修饰位点的定量蛋白质组学数据集,数据模态为蛋白质修饰位点与泛素链信息,主要应用于研究肝细胞癌发生与转移过程中泛素化修饰的动态变化、关键通路及分子机制,为探索肿瘤生物标志物和潜在治疗靶点提供重要基础。

基本信息
资源简介
肝细胞癌泛素化定量蛋白质组图谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Quantitative Proteomic Atlas of Ubiquitination in Hepatocellular Carcinoma》。源站首次发布:2018-11-30。
【数据内容】
源站原始描述:Ubiquitination plays a critical role in human hepatocellular carcinoma (HCC) genesis and metastasis, but how these processes affect systemic ubiquitinome still remains unclear. In this study, our dataset of around 12,000 diGly modified sites was identified providing a valuable insight into HCC. We find both the diGly sites and ubiquitin chains undergo bulk increase in HCC, suggesting the boost of diGly modification activities in tumor genesis. Two of the most significant alterations of ubiquitin…
【主题与分类】
主题标签:Ubiquitination、Hepatocellular、Carcinoma、生物学、组学与图谱。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncmi.cn/phda/dataDetails.do?id=CSTR:A0006.11.A001G.202003.000820
使用许可:完全共享。
规范引用:CSTR:17970.11.A001G.202003.000820
【使用注意】
· 源站最后修改于 2020-11-24,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对肝细胞癌(HCC)的泛素化蛋白质组学数据集,旨在揭示泛素化修饰在HCC发生与转移中的作用。数据集包含约12,000个二甘氨酸(diGly)修饰位点的定量信息,通过蛋白质组学技术鉴定得到。研究发现HCC中泛素化修饰位点及泛素链整体增加,提示肿瘤发生过程中泛素化修饰活性增强。数据进一步显示,HCC中泛素化修饰最显著的变化涉及蛋白酶体组分和抗原呈递相关蛋白。此外,在HCC转移进程中,数据集揭示了更广泛的diGly修饰位点、更短的泛素链特征,并强调了泛素化修饰在细胞间黏附蛋白中的关键作用。该数据集为研究HCC的分子机制、寻找潜在生物标志物及治疗靶点提供了重要资源。
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