RNA编辑与头颈癌
该数据集是一个包含与头颈癌相关的异常RNA编辑事件的生物医学数据集，数据模态为基因序列与临床注释信息，提供了编辑位点位置、编辑类型、编辑频率等详细数据，可用于研究RNA编辑在头颈癌发生发展中的分子机制、识别疾病相关的生物标志物，并支持癌症转录后修饰领域的精准医学研究。
基本信息
资源简介
RNA编辑与头颈癌
【一句话概览】
RNA编辑是一种关键的转录后RNA修饰类型，参与许多生物学过程，并与多种人类疾病相关。该数据资源提供与头颈癌相关的RNA编辑事件及包含疾病ontology在内的描述信息，对每一个异常RNA编辑事件，提供编辑位点位置、编辑类型、编辑频率等信息。相关标签涵盖RNA编辑、疾病、关联、头颈癌、生物学和表观组，许可为完全共享（来源 eScience，完全共享 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2018-09-02。
【数据内容】
源站原始描述：RNA编辑作为一种重要的转录后RNA修饰类型，在许多生物学过程中起着关键作用，涉及多种人类疾病。我们提供与Head and Neck Cancer相关的编辑事件以及包含疾病ontology在内的描述信息，对每一个异常RNA编辑事件，提供编辑位点位置、编辑类型、编辑频率等信息。
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：RNA editing, as an important type of post-transcriptional RNA modification, plays a key role in many biological processes and is involved in various human diseases. We provide editing events associated with Head and Neck Cancer, along with descriptive information including disease ontology. For each abnormal RNA editing event, we provide information such as the editing site location, editing type, and editing frequency.
【主题与分类】
主题标签：RNA编辑、疾病、关联、头颈癌、生物学、表观组。
【获取与许可】
源站页面：https://bigd.big.ac.cn/edk/disease/Head%20and%20Neck%20Cancer
使用许可：完全共享。
规范引用：CSTR:15937.11.edk36
【使用注意】
· 源站最后修改于 2021-05-11，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个专注于RNA编辑与头颈癌关联的生物医学数据集。RNA编辑是一种关键的转录后RNA修饰机制，广泛参与多种生物学过程并与人类疾病密切相关。数据集收录了与头颈癌相关的异常RNA编辑事件，包含每个编辑事件的详细信息，如编辑位点位置、编辑类型（如A-to-I、C-to-U等）和编辑频率，并提供了疾病本体（ontology）描述信息。数据来源于国家基因组科学数据中心，可用于研究RNA编辑在头颈癌发生发展中的作用、识别潜在的生物标志物或治疗靶点，以及探索转录后修饰在癌症中的分子机制。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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