胶质瘤RNA测序数据VISA评分生成
该数据集包含胶质瘤的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，属于转录组模态，通过整合细胞外基质和细胞收缩力相关基因表达，构建虚拟刚度算法（VISA）以推断组织硬度，主要用于胶质瘤的病理机制研究、组织硬度生物信息学预测及肿瘤微环境分析。
基本信息
资源简介
胶质瘤RNA测序数据VISA评分生成
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Generating VISA scores on glioma bulk RNAseq and single cell RNAseq glioma》。源站首次发布：2023-07-24。
【数据内容】
源站原始描述：Tissue stiffness is collectively determined by the stiffness of ECM and cells. Gliomas are characterized by dysregulated expression of ECM proteins, ECM crosslinking enzymes, and aberrant cellular contractility.While The RNA sequencing datasets have been comprehensively analyzed to interrogate tumor genomes, epigenomes, and transcriptomes, we realized an untapped potential: using transcriptomic data coupled with analysis of gene expression associated with ECM and actomyosin contractility to esta…
文件 CGGA.mRNAseq_693_clinical.20200506.txt 为文本内容，开头为：CGGA_ID PRS_type Histology Grade Gender Age OS Censor (alive=0; dead=1) Radio_status (treated=1;un-treated=0) Chemo_status (TMZ treated=1;un-treated=0) IDH_mut…
【数据结构与技术规格】
文件数 11 个，合计 7.05 GB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.8154967。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/8154967
使用许可：cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-07-25，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/record/8154966
（注册/登录后按页面指引下载）
数据说明
该数据集旨在利用胶质瘤的RNA测序数据，通过分析细胞外基质（ECM）和细胞收缩力相关基因表达，构建一个名为虚拟刚度算法（VISA）的生物信息学工具，用于推断组织硬度。数据集包含胶质瘤的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，通过整合转录组信息与ECM蛋白、交联酶及细胞收缩力基因表达，为研究胶质瘤的病理机制提供数据支持。主要应用于胶质瘤的转录组分析、组织硬度预测以及肿瘤微环境研究。
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