胶质瘤批量RNA测序与单细胞RNA测序的VISA评分生成数据集
该数据集包含胶质瘤的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,通过整合细胞外基质和细胞收缩力相关基因的表达信息,构建了虚拟硬度算法(VISA)来推断胶质瘤组织的硬度评分,主要用于研究胶质瘤微环境的生物力学特性、肿瘤进展机制以及潜在的治疗靶点探索。

基本信息
资源简介
胶质瘤批量RNA测序与单细胞RNA测序的VISA评分生成数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Generating VISA scores on glioma bulk RNAseq and single cell RNAseq glioma》。源站首次发布:2023-07-24。
【数据内容】
源站原始描述:Tissue stiffness is collectively determined by the stiffness of ECM and cells. Gliomas are characterized by dysregulated expression of ECM proteins, ECM crosslinking enzymes, and aberrant cellular contractility.While The RNA sequencing datasets have been comprehensively analyzed to interrogate tumor genomes, epigenomes, and transcriptomes, we realized an untapped potential: using transcriptomic data coupled with analysis of gene expression associated with ECM and actomyosin contractility to esta…
文件 CGGA.mRNAseq_693_clinical.20200506.txt 为文本内容,开头为:CGGA_ID PRS_type Histology Grade Gender Age OS Censor (alive=0; dead=1) Radio_status (treated=1;un-treated=0) Chemo_status (TMZ treated=1;un-treated=0) IDH_mut…
【数据结构与技术规格】
文件数 11 个,合计 7.05 GB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.8154967。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/8154967
使用许可:cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-07-25,引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/record/8154966
(注册/登录后按页面指引下载)
数据说明
该数据集是一个用于计算胶质瘤组织硬度评分的生物信息学资源。它基于胶质瘤的批量RNA测序(bulk RNAseq)和单细胞RNA测序(single cell RNAseq)数据,通过分析细胞外基质蛋白、交联酶以及细胞收缩力相关基因的表达,构建了一个名为虚拟硬度算法(VISA)的计算工具,用于推断胶质瘤组织的硬度特性。数据集旨在支持研究人员利用转录组数据探索胶质瘤的微环境力学特征,主要应用于肿瘤生物学、生物力学和精准医疗等领域的研究。
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