胶质瘤基因组数据集

该数据集是一个包含正常人群与胶质瘤患者基因表达谱的基因组学数据集,数据模态为基因表达矩阵,通过分析差异表达基因和相关通路,主要用于胶质瘤的分子机制研究、生物标志物筛选以及癌症基因组学领域的探索。

Mendeley Data
2024-06-19 更新
浏览 38
基因组学胶质瘤
Genomic Glioma Dataset

基本信息

大小
0.025640449 GB
创建/更新时间
2024-06-19
版本
v1

资源简介

胶质瘤基因组数据集

【一句话概览】

该数据集标题为“Genomic -glioma”,来源于基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus),通过分析正常人与胶质瘤患者的基因表达谱,识别差异表达基因(DEGs)及相关通路。数据集共包含35个文件,合计大小25.6 MB(来源 Mendeley Data)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Genomic -glioma》。源站首次发布:2024-06-11。

【数据内容】

源站原始描述:Gene expression profiles from normal people and glioma patients were analyzed using Gene Expression Omnibus to identify differentially expressed genes (DEGs) and pathways

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):使用基因表达综合数据库分析正常人和胶质瘤患者的基因表达谱,以识别差异表达基因(DEGs)和通路。

【数据结构与技术规格】

文件数 35 个,合计 25.64 MB。数据集 DOI:10.17632/64h73rytyz.1。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/64h73rytyz

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源站:https://data.mendeley.com/datasets/64h73rytyz

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个公开的医学基因组数据集,包含正常人群和胶质瘤患者的基因表达谱数据。数据来源于Gene Expression Omnibus(GEO)数据库,通过分析差异表达基因(DEGs)和相关信号通路,旨在识别与胶质瘤发生发展相关的关键基因和分子机制。数据集适用于胶质瘤的分子分型、生物标志物发现、靶向治疗研究以及癌症基因组学领域的探索。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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