中国血流感染患者中碳青霉烯类耐药和毒力质粒的分子特征
该数据集包含从中国血流感染患者血液中收集的425株肺炎克雷伯菌分离株,涵盖基因组序列、质粒特征和抗生素耐药性数据等多模态信息,主要用于研究碳青霉烯类耐药菌的分子机制、毒力质粒的传播特性,以及多重耐药菌株在医院环境中的暴发与防控策略。

基本信息
资源简介
该数据集旨在研究由碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)引起的血流感染(BSIs),这些感染具有潜在的生命威胁并对公共卫生构成紧迫挑战。数据集包含从2005年至2019年间中国九家医院的血流感染患者血液中收集的425株肺炎克雷伯菌分离株。通过整合流行病学和基因组数据,揭示了ST11和ST307型肺炎克雷伯菌与医院内暴发和传播的关联。研究对147个肺炎克雷伯菌基因组和39个完整组装染色体进行了比较分析,发现所有产KPC-2的ST11型分离株中acrR基因被ISKpn26广泛中断,导致AcrAB-Tolc多药外排泵激活,进而降低了对替加环素等七种抗生素的敏感性。此外,数据集描述了29种结构多样的KPC-2质粒、两个产KPC-2肺炎克雷伯菌中的毒力质粒,以及两个新型的多重耐药(MDR)-毒力融合质粒。该研究揭示了KPC-2质粒对肺炎克雷伯菌的多因素影响,可能与多重耐药菌株的医院内传播相关,主要应用于抗生素耐药性机制、细菌基因组学及医院感染控制等研究方向。
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数据说明
该数据集旨在研究由碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)引起的血流感染(BSIs),这些感染具有潜在的生命威胁并对公共卫生构成紧迫挑战。数据集包含从2005年至2019年间中国九家医院的血流感染患者血液中收集的425株肺炎克雷伯菌分离株。通过整合流行病学和基因组数据,揭示了ST11和ST307型肺炎克雷伯菌与医院内暴发和传播的关联。研究对147个肺炎克雷伯菌基因组和39个完整组装染色体进行了比较分析,发现所有产KPC-2的ST11型分离株中acrR基因被ISKpn26广泛中断,导致AcrAB-Tolc多药外排泵激活,进而降低了对替加环素等七种抗生素的敏感性。此外,数据集描述了29种结构多样的KPC-2质粒、两个产KPC-2肺炎克雷伯菌中的毒力质粒,以及两个新型的多重耐药(MDR)-毒力融合质粒。该研究揭示了KPC-2质粒对肺炎克雷伯菌的多因素影响,可能与多重耐药菌株的医院内传播相关,主要应用于抗生素耐药性机制、细菌基因组学及医院感染控制等研究方向。
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