基于胶质母细胞瘤患者特异性模型的单细胞精准医学方法

基于单细胞多组学分析胶质母细胞瘤原发及复发肿瘤,构建调控网络以支持精准医学。

NIAID Data Ecosystem
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基因组胶质母细胞瘤单细胞测序
A single-cell based precision medicine approach using glioblastoma patient specific models

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

该数据集通过多组学单细胞分析(包括RNA-seq和ATAC-seq)对胶质母细胞瘤(GBM)原发肿瘤、标准治疗下小鼠异种移植模型及尸检复发肿瘤进行研究,识别了52个调控因子网络,并开发了共识网络以调控细胞状态转变,为基于单细胞的精准医学提供框架。

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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