颅咽管瘤单细胞RNA测序与空间转录组学主要分析工作流程
该数据集包含用于分析颅咽管瘤单细胞RNA测序和空间转录组学数据的计算脚本（文本模态），主要提供从原始数据处理到细胞注释、差异表达及空间模式识别的完整工作流程，旨在支持颅咽管瘤的分子生物学研究，特别是肿瘤微环境解析和细胞异质性探索等方向。
基本信息
资源简介
颅咽管瘤单细胞RNA测序与空间转录组学主要分析工作流程
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Major Analysis Workflows for Craniopharyngioma scRNA-seq and Spatial Transcriptomics》。源站首次发布：2025-05-17。
【数据内容】
源站原始描述：related scripts
文件 cpsc_epi_pseu.R 为文本内容，开头为：#BiocManager::install("kstreet13/slingshot") suppressMessages({ library(Seurat) library(tidyverse) library(slingshot) library(SingleCellExperiment) }) …
文件 FUN_cpsc_epi_pseu_heatmap.R 为文本内容，开头为：slingshot_pseu_heatmap <- function( seuobj, n_bins, min_exp, cutree_rows, clustering_method, img.output){ #make matrix seurat_meta …
文件 cpsc_epi_pseu_gene.R 为文本内容，开头为：#BiocManager::install("kstreet13/slingshot") BiocManager::install("tradeSeq") suppressMessages({ library(Seurat) library(tidyverse) library(slingshot) …
【数据结构与技术规格】
文件数 17 个，合计 537.51 KB。cpsc_epi_pseu.R：text/plain，2.37 KB。FUN_cpsc_epi_pseu_heatmap.R：text/plain，2.46 KB。cpsc_epi_pseu_gene.R：text/plain，2.85 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.29087423.v6。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell development, proliferation and death。主题标签：craniopharyngiomas、scRNA-seq profiles、spatial transcriptomic analysis、brain tumor 1。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell development, proliferation and death。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/single_cell_annotation/29087423
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：zhang, bin (2025). Major Analysis Workflows for Craniopharyngioma scRNA-seq and Spatial Transcriptomics. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/single_cell_annotation/29087423/6
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
本数据集提供了用于颅咽管瘤研究的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学数据分析的主要工作流程脚本。数据集包含一系列分析脚本，旨在处理从颅咽管瘤样本中获取的单细胞和空间分辨转录组数据。这些脚本可能涵盖数据预处理、细胞类型注释、差异表达分析、空间基因表达模式识别等关键步骤。数据来源于公开的Figshare平台，由研究者上传共享。该数据集主要支持颅咽管瘤的分子生物学研究，特别是肿瘤微环境解析、细胞异质性探索以及空间基因表达特征分析，为肿瘤机制研究和潜在治疗靶点发现提供计算工具支持。
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