肝内胆管癌甲基化异常与基因组不稳定性协同驱动其演化的数据集
该数据集包含了341例不同分期肝内胆管癌(ICC)样本的DNA甲基化谱和体细胞拷贝数变异(SCNAs)数据,属于多组学(表观遗传与基因组)模态的医学研究数据,主要用于探究DNA甲基化异常与基因组不稳定性在ICC恶性进展中的协同作用,为理解癌症演化机制、发现晚期转移的潜在生物标志物以及开发新的诊断工具提供分子层面的依据。
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Methylation_aberrations_and_genomic_instability_synergistically_drive_the_evolution_of_intrahepatic_cholangiocarcinoma/29345535/1
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资源简介
该数据集是一个专注于肝内胆管癌(ICC)的分子生物学研究数据集,旨在探究DNA甲基化异常与基因组不稳定性在癌症进展中的协同作用。数据集包含了341例不同分期的ICC样本的DNA甲基化谱(通过差异甲基化区域DMRs分析)和体细胞拷贝数变异(SCNAs)数据。研究通过分析这些多组学数据,发现晚期(IV期)ICC表现出特定的甲基化改变积累和更高的基因组不稳定性(如非整倍体评分升高和局灶性扩增增加)。此外,研究揭示了SCNA负荷与启动子、基因体和CpG岛区域的DNA甲基化熵呈正相关,并以MDM2基因体为例进行了说明。该数据集为理解ICC的进化轨迹提供了关键分子证据,并表明DNA甲基化可作为转移诊断的潜在生物标志物,主要应用于癌症生物学、表观遗传学、生物标志物发现和精准医疗等研究方向。
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