肝内胆管癌甲基化异常与基因组不稳定性协同驱动其演化的数据集
该数据集包含了341例不同分期肝内胆管癌（ICC）样本的DNA甲基化谱和体细胞拷贝数变异（SCNAs）数据，属于多组学（表观遗传与基因组）模态的医学研究数据，主要用于探究DNA甲基化异常与基因组不稳定性在ICC恶性进展中的协同作用，为理解癌症演化机制、发现晚期转移的潜在生物标志物以及开发新的诊断工具提供分子层面的依据。
基本信息
资源简介
肝内胆管癌甲基化异常与基因组不稳定性协同驱动其演化的数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Methylation aberrations and genomic instability synergistically drive the evolution of intrahepatic cholangiocarcinoma》。配套论文《Methylation aberrations and genomic instability synergistically drive the evolution of intrahepatic cholangiocarcinoma》发表于 Epigenomics（2025），DOI：10.1080/17501911.2025.2518919。项目资助方：This manuscript was funded by the National Natural Science Foundation of China [Project 81773012] and the National Key Research and Development Program of China [2022YFA1105200 and 2023YFA1800700].The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.。源站首次发布：2025-06-18。
【数据内容】
源站原始描述：DNA methylation and genomic instability are critical drivers of cancer initiation and malignant progression. However, the roles of methylation aberrations and genomic instability in malignant progression have not been thoroughly investigated in intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC). To address this, we identified differentially methylated regions (DMRs) and somatic copy number alterations (SCNAs) from 341 ICC samples across various stages. Our findings revealed that stages IAIB, II, IIIA, and II…
【数据结构与技术规格】
文件数 13 个，合计 20.23 MB。FigureS1.tif：image/tiff，2.89 MB。FigureS10.tif：image/tiff，418.08 KB。FigureS11.tif：image/tiff，797.52 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.29345535.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签：Intrahepatic cholangiocarcinoma、DNA methylation、methylation entropy、genomic instability、somatic copy number alterations、malignant progression、diagnosis of metastasis。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Methylation_aberrations_and_genomic_instability_synergistically_drive_the_evolution_of_intrahepatic_cholangiocarcinoma/29345535
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Methylation aberrations and genomic instability synergistically drive the evolution of intrahepatic cholangiocarcinoma. Taylor & Francis. Li, Guanghao; Bai, Youhuang; Tao, Feng; Hu, Tingting; Wang, Ting; Zeng, Yong; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-06-30，引用时请注意版本时效。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个专注于肝内胆管癌（ICC）的分子生物学研究数据集，旨在探究DNA甲基化异常与基因组不稳定性在癌症进展中的协同作用。数据集包含了341例不同分期的ICC样本的DNA甲基化谱（通过差异甲基化区域DMRs分析）和体细胞拷贝数变异（SCNAs）数据。研究通过分析这些多组学数据，发现晚期（IV期）ICC表现出特定的甲基化改变积累和更高的基因组不稳定性（如非整倍体评分升高和局灶性扩增增加）。此外，研究揭示了SCNA负荷与启动子、基因体和CpG岛区域的DNA甲基化熵呈正相关，并以MDM2基因体为例进行了说明。该数据集为理解ICC的进化轨迹提供了关键分子证据，并表明DNA甲基化可作为转移诊断的潜在生物标志物，主要应用于癌症生物学、表观遗传学、生物标志物发现和精准医疗等研究方向。
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