宫颈癌肿瘤组织及癌旁组织的表观转录组图谱

该数据集是一个多模态的宫颈癌表观转录组数据集,包含来自宫颈癌患者的肿瘤组织和癌旁组织的基因测序数据,具体模态包括通过MeRIP-seq检测的m6A修饰数据、通过BisRNA-seq检测的m5C修饰数据以及RNA-seq获得的转录组表达数据。其主要用途是构建宫颈癌中RNA修饰与基因表达的综合图谱,研究表观转录调控在宫颈癌发生发展中的作用规律,并筛选潜在的诊断或预后生物标志物。

中国科学院北京基因组研究所中国科学院北京基因组研究所
干细胞与再生医学数据中心
2023-05-05 更新
浏览 32
宫颈癌m6Am5Ccervical carcinoma人子宫肿瘤转录组表观组
Epitranscriptomic Atlas of Cervical Cancer Tumor and Adjacent Normal Tissues

基本信息

创建/更新时间
2023-05-05

资源简介

宫颈癌肿瘤组织及癌旁组织的表观转录组图谱

【一句话概览】

该研究收集宫颈癌患者肿瘤组织及癌旁组织,分别进行MeRIP-seq和BisRNA-seq检测m6A修饰和m5C修饰,同时对相同来源样本进行RNA-seq获得转录组图谱,以构建m6A、m5C和转录组图谱,解析宫颈癌动态修饰规律,筛选新的表观标志物(来源 ISC 科学数据)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-05-05。

【数据内容】

源站原始描述:收集宫颈癌患者肿瘤组织及癌旁组织,分别进行MeRIP-seq和BisRNA-seq检测m6A修饰和m5C修饰,同时对相同来源样本进行RNA-seq数据获得转录组图谱,以构建m6A、m5C和转录组的图谱,解析宫颈癌动态修饰的规律,筛选新的表观标志物。

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):Collect tumor tissues and adjacent normal tissues from cervical cancer patients. Perform MeRIP-seq and BisRNA-seq to detect m6A and m5C modifications, respectively. Simultaneously, conduct RNA-seq on samples from the same source to obtain transcriptome profiles. This aims to construct maps of m6A, m5C, and the transcriptome, decipher the patterns of dynamic modifications in cervical cancer, and screen for new epigenetic biomarkers.

【主题与分类】

主题标签:宫颈癌、m6A、m5C、cervical carcinoma、m6A、m5C、人、子宫、肿瘤、转录组。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=6454ae10f45ac97dd8ad293f

规范引用:35786.11.d6e7b460b6a143a48c73afcfd58b2635

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=6454ae10f45ac97dd8ad293f

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个针对宫颈癌的表观转录组研究数据集,收集了宫颈癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织样本。通过MeRIP-seq和BisRNA-seq技术分别检测了m6A和m5C两种重要的RNA修饰,并同时对同源样本进行了RNA-seq测序以获得转录组表达谱。数据集旨在构建宫颈癌中m6A、m5C修饰与转录组的综合图谱,解析表观转录修饰在宫颈癌发生发展中的动态变化规律,为筛选新的宫颈癌表观遗传标志物和潜在治疗靶点提供数据支持。主要应用于癌症表观遗传学、生物标志物发现和肿瘤机制研究等领域。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案