宫颈癌肿瘤组织及癌旁组织的表观转录组图谱
该数据集是一个多模态的宫颈癌表观转录组数据集,包含来自宫颈癌患者的肿瘤组织和癌旁组织的基因测序数据,具体模态包括通过MeRIP-seq检测的m6A修饰数据、通过BisRNA-seq检测的m5C修饰数据以及RNA-seq获得的转录组表达数据。其主要用途是构建宫颈癌中RNA修饰与基因表达的综合图谱,研究表观转录调控在宫颈癌发生发展中的作用规律,并筛选潜在的诊断或预后生物标志物。

基本信息
资源简介
宫颈癌肿瘤组织及癌旁组织的表观转录组图谱
【一句话概览】
该研究收集宫颈癌患者肿瘤组织及癌旁组织,分别进行MeRIP-seq和BisRNA-seq检测m6A修饰和m5C修饰,同时对相同来源样本进行RNA-seq获得转录组图谱,以构建m6A、m5C和转录组图谱,解析宫颈癌动态修饰规律,筛选新的表观标志物(来源 ISC 科学数据)。
【数据集背景】
源站首次发布:2023-05-05。
【数据内容】
源站原始描述:收集宫颈癌患者肿瘤组织及癌旁组织,分别进行MeRIP-seq和BisRNA-seq检测m6A修饰和m5C修饰,同时对相同来源样本进行RNA-seq数据获得转录组图谱,以构建m6A、m5C和转录组的图谱,解析宫颈癌动态修饰的规律,筛选新的表观标志物。
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):Collect tumor tissues and adjacent normal tissues from cervical cancer patients. Perform MeRIP-seq and BisRNA-seq to detect m6A and m5C modifications, respectively. Simultaneously, conduct RNA-seq on samples from the same source to obtain transcriptome profiles. This aims to construct maps of m6A, m5C, and the transcriptome, decipher the patterns of dynamic modifications in cervical cancer, and screen for new epigenetic biomarkers.
【主题与分类】
主题标签:宫颈癌、m6A、m5C、cervical carcinoma、m6A、m5C、人、子宫、肿瘤、转录组。
【获取与许可】
源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=6454ae10f45ac97dd8ad293f
规范引用:35786.11.d6e7b460b6a143a48c73afcfd58b2635
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对宫颈癌的表观转录组研究数据集,收集了宫颈癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织样本。通过MeRIP-seq和BisRNA-seq技术分别检测了m6A和m5C两种重要的RNA修饰,并同时对同源样本进行了RNA-seq测序以获得转录组表达谱。数据集旨在构建宫颈癌中m6A、m5C修饰与转录组的综合图谱,解析表观转录修饰在宫颈癌发生发展中的动态变化规律,为筛选新的宫颈癌表观遗传标志物和潜在治疗靶点提供数据支持。主要应用于癌症表观遗传学、生物标志物发现和肿瘤机制研究等领域。
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