阐明鳞状宫颈癌顺铂耐药机制：细胞内DNA修复通路的蛋白质组学见解并探索组学驱动药物重定位的视野
以下数据集包含基于质谱的DIA全局蛋白质组学数据，来源于HPV16+宫颈癌细胞系。主题标签：宫颈癌、顺铂耐药、蛋白质组学、DNA修复、药物重定位、HPV16+
基本信息
资源简介
阐明鳞状宫颈癌顺铂耐药机制：细胞内DNA修复通路的蛋白质组学见解并探索组学驱动药物重定位的视野
该数据集题为“Elucidating cisplatin resistance mechanisms in squamous cervical cancer: Proteomic insights into intracellular DNA repair pathways while exploring the horizons of omics-driven drug repurposing”，由Mukherjee, Amrita、Manna, Sayan、Ray, Adrija、Singh, Avinash与Srivastava, Sanveda等作者共同完成，发布于Zenodo平台，发布时间为2024年。数据集聚焦于肿瘤领域中的宫颈癌方向，核心内容为基于质谱的DIA全局蛋白质组学数据，样本来源于HPV16+宫颈癌细胞系。其主题涵盖宫颈癌、顺铂耐药、蛋白质组学、DNA修复、药物重定位以及HPV16+等关键词，旨在从蛋白质组层面揭示鳞状宫颈癌顺铂耐药机制，并探索胞内DNA修复通路的特征，同时为基于组学驱动的药物重定位研究提供数据基础。该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议开放共享。
【数据集背景】
宫颈癌是严重威胁女性健康的恶性肿瘤之一，其中鳞状宫颈癌是常见的病理类型。高危型人乳头瘤病毒（尤其是HPV16型）的持续感染与宫颈癌的发生发展密切相关。顺铂是宫颈癌临床治疗中常用的化疗药物，但耐药性的产生往往导致疗效下降和预后不良。因此，深入理解顺铂耐药的分子机制，对于优化治疗策略和开发新的干预手段具有重要意义。该数据集正是在这一背景下产生，试图通过蛋白质组学手段，从细胞内DNA修复通路的角度阐释顺铂耐药的可能机制，并进一步探索以组学数据驱动的药物重定位研究方向。数据集标题明确指向“鳞状宫颈癌顺铂耐药机制”的阐明，以及“胞内DNA修复通路”的蛋白质组学洞察，同时将研究视野拓展至“组学驱动的药物重定位”。
【数据内容】
该数据集的核心内容是全局蛋白质组学数据，采用基于质谱的DIA（数据非依赖性采集）技术获得。样本来源于HPV16+宫颈癌细胞系。DIA全局蛋白质组学能够较为全面地检测样本中的蛋白质表达情况，为后续分析耐药相关蛋白、DNA修复通路变化以及潜在药物重定位靶点提供数据支撑。数据集的主题标签包括宫颈癌、顺铂耐药、蛋白质组学、DNA修复、药物重定位和HPV16+，这些标签概括了数据所涉及的生物学问题和研究方向。关于数据的具体文件格式、样本数量、蛋白质鉴定数量、定量结果表格等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于doi.org，发布机构为Zenodo。根据源站描述，数据集包含基于质谱的DIA全局蛋白质组学数据，研究对象为HPV16+宫颈癌细胞系。作者包括Mukherjee, Amrita、Manna, Sayan、Ray, Adrija、Singh, Avinash和Srivastava, Sanveda。发布时间为2024年。关于样本制备方法、质谱仪器型号、色谱条件、数据采集参数等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于宫颈癌特别是鳞状宫颈癌顺铂耐药机制的研究，可用于分析HPV16+宫颈癌细胞系中蛋白质表达变化与DNA修复通路的关系。同时，由于数据集主题涉及药物重定位，也可为基于蛋白质组学数据的药物重定位探索提供参考。此外，该数据集可用于蛋白质组学方法学比较、DIA数据解析流程的测试，以及与其他宫颈癌组学数据的整合分析。对于关注HPV16+宫颈癌基础研究、化疗耐药机制和DNA修复生物学的研究人员，该数据集具有潜在应用价值。关于具体的适用分析工具或软件，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以开放许可方式发布，使用者可依据Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议获取和使用。使用时应遵循署名要求，合理引用数据集来源。由于数据为DIA全局蛋白质组学数据，通常需要借助蛋白质组学数据分析软件进行谱图解析、蛋白质鉴定和定量分析。使用者可根据自身研究目的，对数据中的蛋白质表达信息进行差异分析、通路富集分析或药物重定位预测。关于数据的具体下载方式、文件组织结构和推荐分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于Zenodo平台，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，具有明确的开放共享属性。数据基于质谱DIA技术产生，适用于全局蛋白质组学层面的分析。然而，关于数据的质量控制指标、重复性、覆盖深度、定量准确性等信息，源站未提供。此外，数据集仅涉及HPV16+宫颈癌细胞系，可能无法完全代表临床肿瘤组织的异质性。使用者在解释结果时需注意细胞系模型的局限性。关于数据的具体限制和注意事项，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为Mukherjee, Amrita、Manna, Sayan、Ray, Adrija、Singh, Avinash和Srivastava, Sanveda，发布机构为Zenodo，发布时间为2024年。数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议，允许在署名条件下共享、改编和再利用。使用该数据集时，应按照学术规范进行引用，并遵守许可协议的相关要求。关于具体的引用格式和DOI信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.13132909
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
The following dataset consists of mass spectrometry-based-DIA global proteomics data of HPV16+ cervical cancer cell lines.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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