绝经前后宫颈微生物组与代谢物谱差异及其对宫颈癌进展的意义

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS12691

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

引言：宫颈癌是女性第四大常见恶性肿瘤，主要由高危型人乳头瘤病毒（HPV）持续感染引起。此外，宿主免疫反应、遗传因素和生活方式习惯也具有病因学作用。宫颈阴道微生物组在绝经期间经历动态变化，这可能参与宫颈肿瘤的进展。我们旨在通过整合分析宫颈微生物组、相关代谢物、细胞因子和微小RNA，阐明绝经前后宫颈微环境变化与宫颈肿瘤进展之间的关联。方法：共纳入248例HPV阳性宫颈肿瘤女性，包括17例宫颈上皮内瘤变（CIN1）、80例CIN2、82例CIN3和69例鳞状细胞癌（SCC）。作为正常对照，纳入48例HPV阴性健康女性。每组根据平均绝经年龄50岁进行分层。按照下述方法分析宫颈黏液。

微生物群通过16S rRNA基因测序进行表征，代谢物通过超高效液相色谱-串联质谱分析，RT-qPCR用于miRNA表达分析，RANTES水平通过多珠阵列定量。数据分析使用MicrobiomeAnalyst和MetaboAnalyst进行。结果：在SCC组中，Prevotella和Atopobium是年轻组中的关键细菌属，而Peptoniphilus、Fusobacterium和Porphyromonas在老年组中更为普遍（LDA评分> 4.5）。我们观察到，在CIN2或更严重的年轻组中，Atopobium与黄嘌呤之间存在一致的阳性相关性（p < 0.0001）。然而，在老年女性中未检测到这种相关性。此外，与老年女性相比，在年轻SCC女性中，Atopobium、Adlercreutzia和Gardnerella与烟酸呈显著正相关（p < 0.0001）。在年轻SCC女

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。