肺类癌转录组学分析数据集
该数据集是一个包含肺类癌患者基因测序、转录组测序和DNA甲基化检测的多组学数据集,数据模态涵盖基因组、转录组和表观基因组数据,主要用于研究肺类癌的分子特征、识别不同的分子亚型及其与临床特征的关系,为类癌肿瘤的精准分型、预后评估和治疗策略制定提供科学依据。
创建时间2022-02-20
更新时间2022-02-20
原始链接
http://data.iscr.ac.cn/Article?id=9615f0a8ca3f2960e08d6ec4c60465b8
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资源简介
该数据集是针对肺类癌(一种罕见且生长缓慢的原发性肺部肿瘤)的多组学研究数据集。数据集包含29例样本的354个癌症基因靶向外显子测序数据、30例样本的mRNA测序数据以及18例样本的DNA甲基化检测数据。通过多组学分析发现了与共价组蛋白修饰/染色质重塑(34.5%)和DNA修复(17.2%)通路相关的基因突变,并识别出三个具有不同临床特征的分子亚型(LC1、LC2、LC3)。其中LC2亚型富集MEN1基因突变,LC3亚型主要见于支气管内且发病年龄较早。研究还发现ASCL1和S100两种生物标志物的免疫组化染色可用于区分这三种亚型。该数据集为肺类癌的分子分型、治疗决策和临床管理提供了重要依据。
提供机构:Rutgers Cancer Institute of New Jersey
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