PXD008796:E2F4不依赖RB家族的转录激活

E2F转录因子调控细胞周期进程与命运决定。E2F4是转录抑制因子,参与细胞周期停滞,抑制活性依赖RB家族,常为主要E2F活性

pride
2019-04-26 更新
浏览 30
基因组RbPluripotencyEmbryonic stem cellsP130E2f4Cell cycle
PXD008796: TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION BY E2F4 INDEPENDENT OF THE RB FAMILY

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2019-04-26

资源简介

PXD008796:E2F4不依赖RB家族的转录激活

E2F转录因子调控细胞周期进程与命运决定。E2F4是转录抑制因子,参与细胞周期停滞,抑制活性依赖RB家族,常为主要E2F活性。E2F4对小鼠胚胎干细胞增殖和生存重要,并部分作为转录激活因子促进细胞周期基因表达,独立于RB家族。E2F4互作组无偏分析在RB家族突变细胞中,E2F4与激活相关染色质调节因子互作。揭示E2F4非经典作用,为快速分裂细胞提供新见解(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):E2F 转录因子是哺乳动物细胞中细胞周期进程和细胞命运决定的核心调控因子。E2F4 是一种转录抑制因子,与细胞周期停滞有关,其抑制活性依赖于其与 RB 家族成员的相互作用。E2F4 通常代表细胞中主要的 E2F 活性。在此,我们表明 E2F4 对小鼠胚胎干细胞的增殖和存活至关重要。在这些细胞中,E2F4 部分作为转录激活因子发挥作用,促进细胞周期基因的表达。重要的是,E2F4 的这一作用完全独立于 RB 家族。因此,对 E2F4 相互作用组进行的无偏倚分析显示,在 RB 家族突变细胞中,E2F4 与与基因激活相关的染色质调控因子发生功能性相互作用。综上所述,我们的发现揭示了 E2F4 的一种非经典作用,为快速分裂细胞类型的生物学提供了新见解。

【主题与分类】

主题标签:Rb、Pluripotency、Embryonic stem cells、P130、E2f4、Cell cycle。本站分类:肿瘤/癌症(总论)。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD008796

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD008796

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E2F 转录因子是哺乳动物细胞中细胞周期进程和细胞命运决定的核心调控因子。E2F4 是一种转录抑制因子,与细胞周期停滞有关,其抑制活性依赖于其与 RB 家族成员的相互作用。E2F4 通常代表细胞中主要的 E2F 活性。在此,我们表明 E2F4 对小鼠胚胎干细胞的增殖和存活至关重要。在这些细胞中,E2F4 部分作为转录激活因子发挥作用,促进细胞周期基因的表达。重要的是,E2F4 的这一作用完全独立于 RB 家族。因此,对 E2F4 相互作用组进行的无偏倚分析显示,在 RB 家族突变细胞中,E2F4 与与基因激活相关的染色质调控因子发生功能性相互作用。综上所述,我们的发现揭示了 E2F4 的一种非经典作用,为快速分裂细胞类型的生物学提供了新见解。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案