PXD015635:小鼠胚胎干细胞与膀胱癌细胞中TFCP2L1的CDK1磷酸化鉴定

该数据集来自ebi.ac.uk,聚焦CDK1对多能性相关转录因子TFCP2L1的磷酸化修饰。研究显示,Tfcp2l1在小鼠胚胎干细胞中参与细胞周期调控,其Thr177位点被Cdk1磷酸化,影响干细胞的细胞周期进程、多能性与分化;该通路在人膀胱癌细胞中被异常激活并促进增殖

pride
2019-11-08 更新
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蛋白质PluripotencyCdk1Stemness featuresEmbryonic stem-cellBladder cancer
PXD015635: Identification of CDK1 phosphorylation of TFCP2L1 from murine embryonic stem cells and bladder cancer cells

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2019-11-08

资源简介

PXD015635:小鼠胚胎干细胞与膀胱癌细胞中TFCP2L1的CDK1磷酸化鉴定

该数据集来自ebi.ac.uk,聚焦CDK1对多能性相关转录因子TFCP2L1的磷酸化修饰。研究显示,Tfcp2l1在小鼠胚胎干细胞中参与细胞周期调控,其Thr177位点被Cdk1磷酸化,影响干细胞的细胞周期进程、多能性与分化;该通路在人膀胱癌细胞中被异常激活并促进增殖。数据通过免疫沉淀与激酶实验获得TFCP2L1蛋白,并利用LC-MS鉴定Thr177磷酸化,可用于研究胚胎发育与肿瘤去分化、转移之间的分子联系(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):参与胚胎发生的分子程序在致癌去分化和转移中经常上调。然而,其确切作用和调控机制仍不清楚。在这里,我们展示了CDK1对TFCP2L1(一种多能性相关转录因子)的磷酸化,在胚胎干细胞(ESCs)中协调了多能性和细胞周期,并在侵袭性膀胱癌(BCs)中被异常激活。在小鼠ESCs中,Tfcp2l1的蛋白质相互作用组和转录靶点表明其参与细胞周期调控。Tfcp2l1在Thr177位点被Cdk1磷酸化,这影响了ESC的细胞周期进程、多能性和分化。LC-MS被用于表征通过IP实验和激酶测定获得的TFCP2L1蛋白中的Thr177磷酸化。CDK1-TFCP2L1通路在人BC细胞中被激活,刺激其增殖、自我更新

【主题与分类】

主题标签:Pluripotency、Cdk1、Stemness features、Embryonic stem-cell、Bladder cancer。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD015635

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

参与胚胎发生的分子程序在肿瘤性去分化和转移中常被上调。然而,其确切作用和调控机制仍不清楚。在此,我们表明,CDK1对TFCP2L1(一种与多能性相关的转录因子)的磷酸化协调了胚胎干细胞(ESCs)中的多能性和细胞周期,并在侵袭性膀胱癌(BCs)中异常激活。在小鼠ESCs中,Tfcp2l1的蛋白互作组和转录靶点表明其参与细胞周期调控。Tfcp2l1在Thr177位点被Cdk1磷酸化,这影响了ESC的细胞周期进程、多能性和分化。采用LC-MS对通过IP实验和激酶实验获得的TFCP2L1蛋白中Thr177磷酸化进行表征。CDK1-TFCP2L1通路在人BC细胞中被激活,促进其增殖、自我更新和侵袭。在异种移植模型中,TFCP2L1磷酸化缺失削弱了BC细胞的致瘤能力。

在膀胱癌(BC)患者中,TFCP2L1和CDK1的高共表达与不良临床特征相关,包括肿瘤分级、淋巴血管侵犯、固有肌层浸润和远处转移,并且是癌症特异性生存的独立预后因素。这些发现证明了CDK1介导的TFCP2L1磷酸化在干细胞多能性以及与BC进展相关的致瘤性干性特征中的分子和临床意义。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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