巴基斯坦患者三阴性乳腺癌的全外显子组测序
巴基斯坦三阴性乳腺癌患者全外显子组测序数据集，用于构建该人群分子突变谱。
基本信息
资源简介
巴基斯坦患者三阴性乳腺癌的全外显子组测序
【一句话概览】
三阴性乳腺癌具有遗传异质性，不同族裔人群的突变谱各异。东南亚人群相关突变谱研究存在明显空白，巴基斯坦人群则尚属空白，亟需识别可用于明确治疗干预的临床可操作遗传变异。本项目将对巴基斯坦三阴性乳腺癌组织样本进行全外显子组测序，以启动该人群分子图谱的构建（PRJNA1298555，Ziauddin Medical University）（来源 NCBI）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Whole exome sequencing of triple negative breast cancer in Pakistani patients》。源站首次发布：2025-08-08。
【数据内容】
源站原始描述：TNBC is a genetically heterogeneous disease with diverse mutational profiles among patient cohorts from different ethnic backgrounds. There is a major gap in knowledge pertaining to the mutational profiles of TNBCs in Southeast Asian and is non-existent for Pakistani population. There is a dire need to distinguish clinically actionable genetic variants for definite therapeutic intervention. Whole-exome sequencing of TNBC tissue samples will initiate development of a molecular profile of Pakistan…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：TNBC是一种遗传异质性疾病，不同族裔背景的患者队列具有多样的突变谱。关于东南亚人群TNBC突变谱的知识存在重大空白，而巴基斯坦人群的相关知识则完全空白。迫切需要识别临床可操作的遗传变异，以进行明确的治疗干预。对TNBC组织样本进行全外显子组测序，将启动巴基斯坦三阴性乳腺癌患者分子图谱的构建。
【主题与分类】
主题标签：PRJNA1298555、Ziauddin Medical University。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP606210
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP606210
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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