研究侵袭性乳腺癌、导管或小叶原位癌或良性乳腺疾病女性的血液与肿瘤组织样本

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦乳腺癌相关研究,涵盖侵袭性乳腺癌、导管或小叶原位癌以及良性乳腺疾病女性人群

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clinicaltrials
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蛋白质预测Breast Cancer
Studying Blood and Tumor Tissue Samples in Women With Invasive Breast Cancer, Ductal or Lobular Carcinoma in Situ, or Benign Breast Disease

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

研究侵袭性乳腺癌、导管或小叶原位癌或良性乳腺疾病女性的血液与肿瘤组织样本

该数据集英文名为 Studying Blood and Tumor Tissue Samples in Women With Invasive Breast Cancer, Ductal or Lobular Carcinoma in Situ, or Benign Breast Disease,来源于 clinicaltrials.gov,在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为 Breast Cancer。其研究聚焦于女性乳腺疾病人群,覆盖侵袭性乳腺癌、导管或小叶原位癌以及良性乳腺疾病三类对象,并围绕外周血标本的采集、标本库建立以及分子检测方法在诊断区分、治疗反应预测和复发预测中的潜在价值展开。整体来看,该数据集所对应的研究强调标准化临床随访与系列标本采集,尤其针对侵袭性乳腺癌患者进行连续采样,以支持对疾病进程和治疗结局的纵向分析。该数据集适合关注乳腺癌血液标志物、肿瘤组织样本研究以及分子诊断技术评估的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集对应的研究关注女性乳腺疾病的全谱系,包括侵袭性乳腺癌、导管或小叶原位癌以及良性乳腺疾病。研究目标之一是建立来自外周血标本的标本库,并针对侵袭性乳腺癌患者开展标准化临床随访和系列标本采集。这一背景说明该数据集并非仅针对单一乳腺癌亚型,而是试图覆盖从良性乳腺疾病到原位癌再到侵袭性乳腺癌的不同疾病状态,从而为比较不同病理阶段之间的分子特征提供基础。源站描述中列出的条件为 Breast Cancer,进一步表明其核心关注点为乳腺癌相关疾病。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集涉及外周血标本以及肿瘤组织样本的研究。其研究目标包括:建立来自女性乳腺疾病全谱系患者外周血标本的标本库,并对侵袭性乳腺癌患者进行标准化临床随访和系列标本采集;评估定量实时逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)通过比较活检前标本的基线检测值与组织学诊断,区分侵袭性乳腺癌、原位癌和良性乳腺疾病患者的能力;评估 qRT-PCR 通过比较可评估侵袭性乳腺癌患者的系列检测值与客观缓解情况,预测治疗反应的能力;以及评估 qRT-PCR 通过比较所有侵袭性乳腺癌患者的系列检测值与疾病结局,预测复发的能力。源站描述在复发预测目标处未完整结束,因此该部分完整信息源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。源站描述显示,研究涉及从女性乳腺疾病患者采集外周血标本,并对侵袭性乳腺癌患者进行系列标本采集和标准化临床随访。标本类型包括外周血标本,数据集英文名中还提及肿瘤组织样本。关于具体的采集时间点、采集频率、样本量、随访时长、研究机构数量与地点等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌相关研究场景,尤其是围绕外周血标本库建设、乳腺疾病不同病理阶段之间的分子鉴别、治疗反应预测以及复发预测等方向。其研究设计覆盖侵袭性乳腺癌、导管或小叶原位癌和良性乳腺疾病,因此可用于探索 qRT-PCR 检测值在良恶性乳腺疾病区分中的潜在应用,也可用于分析侵袭性乳腺癌患者在治疗过程中的系列检测值变化与客观缓解之间的关系。此外,对于关注标准化临床随访与系列标本采集方法的研究者,该数据集所对应的研究框架也具有参考意义。关于具体适用人群的年龄范围、纳入排除标准、治疗类型和研究终点定义等信息,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来自 clinicaltrials.gov,使用者可通过该来源获取相关研究记录。源站描述中提及的研究方法包括定量实时逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR),并涉及将基线检测值与组织学诊断进行比较、将系列检测值与治疗客观反应进行比较、将系列检测值与疾病结局进行比较。关于数据的具体获取方式、访问权限、下载格式、是否开放原始数据、是否需要申请审批以及配套文档等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集对应的研究目标包括建立标本库、评估 qRT-PCR 的区分能力、治疗反应预测能力和复发预测能力。源站描述未提供样本量、统计效能、缺失数据情况、随访完整度、检测方法的标准操作流程、质量控制措施以及研究局限性等信息。源站描述中关于复发预测的部分内容不完整,因此无法据此判断该目标的完整表述。此外,源站未提供研究是否已完成、结果是否已发表以及数据是否经过同行评审等信息。使用者在解释和应用该数据集时,应结合源站记录的完整内容进行判断。

【引用与许可】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制、数据共享政策以及版权归属等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00898508

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病:乳腺癌。目的:主要 * 建立一个标本库,收集来自患有各种乳腺疾病(浸润性乳腺癌[IBC]、导管或小叶原位癌[CIS]或良性乳腺疾病[BBD])女性的外周血标本,并对IBC患者进行标准化临床随访和连续标本采集。 * 通过比较活检前标本的基线检测值与组织学诊断,确定定量实时逆转录PCR(qRT-PCR)区分IBC、CIS和BBD患者的能力。 * 通过比较可评估IBC患者的连续检测值与客观缓解情况,确定qRT-PCR预测治疗反应的能力。 * 通过比较所有IBC患者的连续检测值与疾病状态,确定qRT-PCR预测复发的能力。 * 通过比较所有IBC患者的基线检测值与疾病状态(按已知乳腺癌预后因素分层),确定qRT-PCR作为独立预后因素的能力。

次要目标 * 进行探索性研究,以确定新型核酸和蛋白质组学早期检测 assay 的潜在靶点。大纲:患者在活检前接受基线外周血标本采集,随后定期采集,持续长达10年。通过定量实时逆转录PCR、免疫荧光和双向焦磷酸解激活聚合酶等位基因特异性扩增分析标本中的循环肿瘤细胞;并通过质谱、液相色谱、酶消化和串联质谱分析蛋白质谱。分析患者的肿瘤组织(仅限浸润性乳腺癌[IBC])通过IHC检测p53。定期审查医疗记录。IBC患者在基线和每6个月完成一次生活质量评估,持续长达10年。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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