Duke乳腺癌MRI数据集

Duke-Breast-Cancer-MRI 是与癌症(Cancer)相关的公开数据资源,主要包含922例活检证实乳腺癌患者动态增强MRI和肿瘤位置数据,数据模态为图像,适合用于图像分割、模型训练、基准评测或临床特征分析。

Duke University; TCIADuke University; TCIA
TCIA
2022-08-01 更新
浏览 67
图像图像分割Breast Cancer
Duke-Breast-Cancer-MRI

基本信息

模态
图像
大小
368.89 GB
数据量
922
任务类型
图像分割
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2022-08-01
版本
Complete

资源简介

Duke乳腺癌MRI数据集

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开的影像数据集,收录 合计 368.89 GB、922 例受试者,主题涵盖 Breast Cancer,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,CC BY-NC 4.0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Dynamic contrast-enhanced magnetic resonance images of breast cancer patients with tumor locations》。源站首次发布:2022/08/01。

【数据内容】

源站原始描述:Breast MRI is a common image modality to assess the extent of disease in breast cancer patients. Recent studies show that MRI has a potential in prognosis of patients’ short and long-term outcomes as well as predicting pathological and genomic features of the tumors. However, large, well annotated datasets are needed to make further progress in the field. We share such a dataset here

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):乳腺MRI是评估乳腺癌患者疾病范围的一种常用影像学方法。近期研究表明,MRI在预测患者短期和长期结局以及预测肿瘤的病理学和基因组特征方面具有潜力。然而,要推动该领域取得进一步进展,仍需要大规模、注释完善的数据集。我们在此分享这样一个数据集。

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/TCIA.e3sv-re93。

【主题与分类】

源站学科分类:Segmentation、SEG、Other、Radiomic Feature、Measurement、Classification。主题标签:Breast Cancer。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/duke-breast-cancer-mri/

使用许可:CC BY-NC 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。

规范引用:Saha, A., Harowicz, M. R., Grimm, L. J., Weng, J., Cain, E. H., Kim, C. E., Ghate, S. V., Walsh, R., & Mazurowski, M. A. (2021). Dynamic contrast-enhanced magnetic resonance images of breast cancer patients with tumor locations [Data set] . The Cancer Imaging Archive

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据集大小约 368.89 GB。

数据说明

Duke乳腺癌MRI数据集包含922例活检证实乳腺癌患者动态增强MRI和肿瘤位置数据,可用于癌症相关的图像分割研究。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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