ST000054:正常乳腺与乳腺癌的代谢微环境(MS分析)
数据可用于比较正常乳腺组织与乳腺癌组织之间的代谢物差异,识别与肿瘤微环境相关的代谢特征,并支持乳腺癌代谢分型或分类建模等研究(来源 metabolomicsworkbench.org)

基本信息
资源简介
ST000054:正常乳腺与乳腺癌的代谢微环境(MS分析)
ST000054 是一个以代谢组学手段研究正常乳腺组织与乳腺癌组织之间代谢差异的数据集,英文全称为 Metabolic Microenvironments in Normal Breast and Breast Cancer (MS analysis)。该数据集来源于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),在肿瘤 / 乳腺癌分类下收录,采用气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术,研究对象为人类(Homo sapiens),数据由北卡罗来纳大学提供。整体来看,该数据集可用于比较正常乳腺组织与乳腺癌组织之间的代谢物差异,识别与肿瘤微环境相关的代谢特征,并支持乳腺癌代谢分型或分类建模等研究,为从代谢层面理解乳腺癌的发生发展提供数据基础。
【数据集背景】
乳腺癌是严重威胁女性健康的恶性肿瘤之一,其发生发展与肿瘤微环境中的代谢重编程密切相关。肿瘤细胞为满足快速增殖的需求,往往表现出与正常组织不同的代谢特征,例如能量代谢途径的改变、特定代谢物水平的升高或降低等。对这些代谢差异的系统研究,有助于揭示肿瘤微环境的代谢规律,并为乳腺癌的分子分型和精准诊疗提供线索。该数据集正是在这一研究背景下产生,聚焦正常乳腺组织与乳腺癌组织之间的代谢物比较,属于肿瘤代谢组学与乳腺癌研究交叉领域的数据资源。
【数据内容】
该数据集的核心内容为正常乳腺组织与乳腺癌组织样本的代谢组学检测结果,检测手段为气相色谱-质谱联用(GC-MS)。通过该技术可以获得样本中挥发性及可衍生化代谢物的定性和定量信息,从而支撑两类组织之间代谢物差异的比较分析。基于这些数据,研究者可以识别与肿瘤微环境相关的代谢特征,并进一步用于乳腺癌代谢分型或分类建模等研究。数据集在来源站被归类于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为 GC-MS,体现了其技术路线与应用领域的双重属性。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 metabolomicsworkbench.org,源站描述显示其为一项目标物种为人类(Homo sapiens)的代谢组学研究,采用 GC-MS 方法,研究机构为北卡罗来纳大学(University of North Carolina)。数据集英文名称中包含 “Metabolic Microenvironments in Normal Breast and Breast Cancer (MS analysis)”,表明其研究主题为正常乳腺与乳腺癌中的代谢微环境。关于样本采集的具体流程、样本数量、伦理审批信息以及实验操作的详细参数,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于多类研究场景。首先,可用于比较正常乳腺组织与乳腺癌组织之间的代谢物差异,寻找潜在的差异代谢物。其次,可用于识别与肿瘤微环境相关的代谢特征,帮助理解肿瘤代谢重编程的规律。此外,还可支持乳腺癌代谢分型或分类建模等研究,例如以代谢物水平为特征构建分类模型,区分正常组织与肿瘤组织,或探索不同代谢亚型。对于从事肿瘤代谢组学、乳腺癌生物标志物发现以及代谢通路分析的研究人员,该数据集具有一定的参考价值。
【使用方法】
使用该数据集时,通常需要先获取源站提供的代谢组学数据文件,了解其数据格式与代谢物注释信息,然后进行数据预处理,包括缺失值处理、归一化或标准化等步骤。在此基础上,可采用统计分析方法比较正常组织与乳腺癌组织之间的代谢物差异,并结合通路富集分析等手段解释生物学意义。若用于分类建模,可将代谢物丰度作为特征,构建并评估分类模型。关于该数据集的具体文件格式、预处理建议及分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,由北卡罗来纳大学提供,采用 GC-MS 技术,具有一定的技术可靠性。但需要注意的是,GC-MS 主要覆盖可挥发或可衍生化的代谢物,对部分极性大、热不稳定或难挥发的代谢物检测能力有限,因此代谢物覆盖范围存在方法学上的局限。此外,关于样本量、样本来源、临床信息完整性以及数据质量控制指标等,源站未提供,使用者在解释结果时需结合自身研究设计谨慎判断。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 metabolomicsworkbench.org,研究机构为北卡罗来纳大学。关于具体的引用格式、数据许可条款以及使用限制,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集前,应自行查阅来源站的相关说明,并遵循其发布的使用规范与学术引用要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST000054
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Metabolomics study (GC-MS). Species: Homo sapiens. Institute: University of North Carolina.
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




