NMO抑郁相关代谢组数据集

NMO抑郁相关代谢组数据集 是真实存在且可公开访问或申请访问的数据集,包含表格数据、标签、临床变量或随访信息。它可用于视神经脊髓炎谱系疾病领域的NMOSD登记分析、OCT视网膜损伤评估、代谢组/多组学生物标志物和脱髓鞘疾病鉴别,支持模型训练、基准复现和跨队列验证。

NIH Common Fund Metabolomics WorkbenchNIH Common Fund Metabolomics Workbench
Metabolomics Workbench
2018-01-01 更新
浏览 31
表格分类Neuromyelitis OpticaDepressionAstrocytesTCAGlutamateGC-MSHumanHomo sapiens
Metabolomics Workbench NMO Study ST001036

基本信息

模态
表格
任务类型
分类
创建/更新时间
2018-01-01

资源简介

NMO抑郁相关代谢组数据集

【一句话概览】

视神经脊髓炎(NMO)患者抑郁水平升高,其体内抗体识别脑内星形胶质细胞并触发应激反应,导致脑损伤、残疾和认知障碍。研究观察到NMO患者抑郁相关脑区谷氨酸水平变化,谷氨酸减少被认为会降低特定神经环路活动而引发抑郁。基于星形胶质细胞维持谷氨酸水平的作用,研究假设NMO抗体干扰星形胶质细胞代谢活动,从而降低谷氨酸并触发抑郁。研究拟测量NMO星形胶质细胞中TCA浓度,希望了解NMO星形胶质细胞失调机制及抑郁症一般机制,以期带来新疗法。受试者数1(来源 metabolomicsworkbench.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《TCA Concentrations in Neuromyelitis Optica Patients (part - II)》。

【数据内容】

源站原始描述:Patients with an inflammatory disease of the central nervous system known as neuromyelitis optica (NMO) experience increased levels of depression. These patients have an antibody that recognizes a type of cell in the brain called astrocytes – binding of this antibody to astrocytes triggers a stress response in the cell that results in the development of brain lesions that cause disability and cognitive disturbances. We recently observed a change in the level of glutamate in a part of the brain i…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):患有中枢神经系统炎性疾病——视神经脊髓炎(NMO)的患者,其抑郁水平升高。这些患者体内存在一种抗体,能够识别大脑中一种称为星形胶质细胞的细胞——该抗体与星形胶质细胞结合后,会触发细胞内的应激反应,进而导致脑部病灶的形成,造成功能障碍和认知障碍。我们最近观察到,NMO患者大脑中与抑郁相关的区域谷氨酸水平发生了变化。谷氨酸是大脑中用于神经元之间通讯的化学物质——谷氨酸水平降低被认为会通过减少特定神经环路中的神经元活动而引发抑郁。基于这一观察以及星形胶质细胞在维持脑内谷氨酸水平中的已知作用,我们假设NMO抗体干扰了星形胶质细胞的代谢活动,从而降低谷氨酸并引发抑郁。我们计划测定NMO星形胶质细胞中的TCA浓度。我们希望不仅能了解视神经脊髓炎中星形胶质细胞失调的机制,还能了解抑郁症的一般机制,从而可能为该疾病带来新的治疗方法。

【主题与分类】

主题标签:Neuromyelitis Optica、Depression、Astrocytes、TCA、Glutamate、GC-MS、Human、Homo sapiens。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST001036

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源站:https://www.metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST001036

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

NMO抑郁相关代谢组数据集 提供 NMO 患者与抑郁相关代谢组检测数据和研究元信息,适合视神经脊髓炎谱系疾病相关的NMOSD登记分析、OCT视网膜损伤评估、代谢组/多组学生物标志物和脱髓鞘疾病鉴别。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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