ST002859:溶媒与恩扎卢胺处理的16D前列腺癌细胞葡萄糖示踪
ST002859 是一项以气相色谱-质谱联用(GC-MS)为主要分析手段的代谢组学研究,研究对象为人前列腺癌细胞系 16D,研究设计为在载体溶剂对照(vehicle)与恩杂鲁胺(Enzalutamide)处理两种条件下开展葡萄糖示踪实验,用以观察细胞对葡萄糖的摄取与代谢流向变化

基本信息
资源简介
ST002859:溶媒与恩扎卢胺处理的16D前列腺癌细胞葡萄糖示踪
ST002859 是一项以气相色谱-质谱联用(GC-MS)为主要分析手段的代谢组学研究,研究对象为人前列腺癌细胞系 16D,研究设计为在载体溶剂对照(vehicle)与恩杂鲁胺(Enzalutamide)处理两种条件下开展葡萄糖示踪实验,用以观察细胞对葡萄糖的摄取与代谢流向变化。该数据集由 Metabolomics Workbench 收录,在本站归入肿瘤/前列腺癌分类,主题标签为 GC-MS。
【数据集背景】
前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤之一,其发生与进展在相当程度上依赖雄激素受体信号通路。恩杂鲁胺是一类雄激素受体靶向药物,在临床上用于前列腺癌的治疗;当肿瘤细胞在药物压力下发生代谢适应时,糖代谢通路的重编程往往是研究者关注的重点之一。葡萄糖是细胞能量供应与生物合成的重要碳源,通过向其引入稳定同位素标记,可以追踪碳骨架在糖酵解、三羧酸循环及相关氨基酸、有机酸池中的分布,从而判断不同处理条件下代谢通路的活跃程度与流向差异。本数据集正是在这一研究思路下,对 16D 前列腺癌细胞在载体溶剂对照与恩杂鲁胺处理条件下的葡萄糖代谢进行对比性示踪分析。数据集名称中同时标明了两类处理组与示踪底物,说明其核心变量为药物处理状态,而非单纯的基础代谢谱比较。除上述信息外,研究的假设、预期目标与实验结论源站未提供。
【数据内容】
从名称与主题标签可以确认,数据集包含以 GC-MS 平台产生的代谢组学检测结果,样本来自经载体溶剂与恩杂鲁胺分别处理、并在葡萄糖示踪条件下培养的 16D 人前列腺癌细胞;研究种属为人(Homo sapiens)。GC-MS 适用于检测多种挥发性衍生化代谢物,如有机酸、氨基酸、糖及糖醇类化合物,因此此类数据常用于刻画中心碳代谢相关代谢物的丰度与同位素标记分布。关于数据集内具体包含的样本数量、生物学重复数、示踪所用的标记葡萄糖类型与标记位置、取样时间点、检测到的代谢物数目与名称清单、原始图谱与处理后数据表的组织方式,源站未提供。
【采集与来源】
数据集收录于代谢组学数据平台 Metabolomics Workbench,访问标识为 ST002859。源站说明该研究由 University of California, Los Angeles(加州大学洛杉矶分校)完成,研究种属为人,检测技术为 GC-MS。至于样本制备流程、衍生化试剂、内标选择、气相色谱柱型号、质谱仪型号与采集参数、数据处理与峰识别软件、代谢物定性定量所依据的数据库等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕前列腺癌细胞代谢重编程开展的分析与再利用工作,例如比较药物处理与对照条件下中心碳代谢的差异、考察雄激素受体靶向干预对糖代谢通路的影响,以及作为代谢组学方法学与数据处理流程的示例数据。由于其建立在葡萄糖示踪设计之上,也可用于涉及同位素标记数据分析流程的验证与教学演示。上述用途属于此类代谢组学数据的常见应用方向,具体能支撑哪些分析,取决于源站实际公开的数据层级与元数据完整程度;源站未提供关于具体应用场景的说明。
【使用方法】
数据集的获取入口为 Metabolomics Workbench,可通过其收录编号 ST002859 检索定位。关于可下载的文件格式、数据层级划分(原始图谱、处理后丰度表或同位素分布表)、是否提供分析脚本与使用说明、是否需要注册或遵循特定访问流程,源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量的评价信息,包括重复性、缺失值比例、批次效应、定量准确性或同位素标记富集度等方面的说明;也未提供数据可能存在的适用边界与已知局限。使用者在开展二次分析前,应自行核查数据完整性与分析适用性。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、作者列表、发表文献信息以及使用许可与再分发条款。如需引用或用于发表,请以 Metabolomics Workbench 页面公布的信息为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST002859
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
代谢组学研究(GC-MS)。物种:智人。机构:加利福尼亚大学洛杉矶分校。
数据缺失?
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