小RNA测序揭示新型tsRNA-26576介导乳腺癌肿瘤发生

目的:作为起源于乳腺组织的恶性肿瘤,乳腺癌已被广泛视为全球范围内威胁女性健康的最常见癌症类型。新出现的证据表明,tsRNA可能在多种癌症的肿瘤发生和进展中发挥重要作用

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基因组分类乳腺癌tsRNA小RNA测序肿瘤发生差异表达RT-PCR
Small RNA sequencing reveals a novel tsRNA-26576 mediating tumorigenesis of breast cancer

基本信息

模态
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创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

小RNA测序揭示新型tsRNA-26576介导乳腺癌肿瘤发生

乳腺癌是全球范围内威胁女性健康的最常见恶性肿瘤类型之一。近年来,随着小RNA测序技术的发展,tsRNA在肿瘤发生与进展中的潜在作用逐渐受到关注。然而,tsRNA在乳腺癌中的具体功能仍 largely 未知。该数据集围绕一项探索性研究构建,旨在通过小RNA测序手段,系统评估乳腺癌患者组织中tsRNA的异常表达状态,并进一步聚焦于tsRNA-26576在乳腺癌肿瘤发生中的功能。研究对四例癌症组织与四例癌旁正常组织进行了小RNA测序,鉴定出263个显著差异表达的tsRNA,其中75个上调、188个下调,并利用RT-PCR检测了tsRNA-26576在乳腺癌患者中的表达水平。该数据集为乳腺癌tsRNA相关研究提供了原始测序与表达分析的基础资源。

【数据集背景】

乳腺癌作为起源于乳腺组织的恶性肿瘤,长期以来被视为全球女性健康面临的最常见癌症类型。尽管诊疗手段不断进步,其肿瘤发生与进展的分子机制仍有待深入阐明。tsRNA是一类新兴的非编码小RNA,已有证据提示其可能在多种癌症的发生和进展中扮演重要角色。然而,针对乳腺癌中tsRNA的功能研究仍十分有限,尤其是特定tsRNA分子在肿瘤发生中的调控作用尚不明确。在此背景下,该数据集对应的研究聚焦于tsRNA-26576,试图通过小RNA测序与表达验证相结合的策略,揭示其在乳腺癌肿瘤发生中的潜在功能,从而为乳腺癌分子机制研究提供新的切入点。

【数据内容】

该数据集的核心内容来自乳腺癌患者组织的小RNA测序分析。研究共纳入四例癌症组织与四例相邻正常组织,通过小RNA测序评估tsRNA的异常表达状态。分析结果显示,共有263个tsRNA被鉴定为显著差异表达,其中75个表达上调,188个表达下调。在此基础上,研究进一步采用RT-PCR方法检测了tsRNA-26576在乳腺癌患者中的表达水平。数据集英文名称为“Small RNA sequencing reveals a novel tsRNA-26576 mediating tumorigenesis of breast cancer”,本站分类归入肿瘤 / 乳腺癌方向。除上述测序与表达检测内容外,源站未提供更细粒度的数据文件列表、样本临床信息或原始数据格式说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为search.dataone.org。根据源站描述,研究采集了乳腺癌患者的癌症组织与相邻正常组织,样本数量为四例癌症组织和四例相邻正常组织。采集方式为小RNA测序,用于评估tsRNA的失调状态;随后通过RT-PCR检测tsRNA-26576的表达水平。关于样本的具体采集时间、采集地点、伦理审批信息、患者纳入排除标准以及测序平台型号等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌相关的基础与转化研究场景,尤其是涉及tsRNA表达谱分析、差异表达筛选以及特定tsRNA功能验证的研究。具体而言,可用于探索乳腺癌与癌旁正常组织之间tsRNA表达差异,识别候选tsRNA分子,并为后续针对tsRNA-26576的机制研究或生物标志物开发提供数据参考。此外,该数据集也可用于小RNA测序数据分析流程的验证、差异表达分析方法的比较,以及tsRNA在肿瘤发生中作用的教学演示。但需注意,其适用性受限于样本规模与源站所提供的信息范围。

【使用方法】

使用者可基于该数据集开展tsRNA差异表达分析,重点关注263个显著差异表达tsRNA中的上调与下调分子,并进一步考察tsRNA-26576的表达变化。研究设计中包含了小RNA测序与RT-PCR两种技术手段,使用时可结合测序结果与RT-PCR验证结果进行交叉比对。对于希望复现或扩展该研究的用户,可参考源站描述中提及的“四例癌症组织与四例相邻正常组织”的样本设计,以及“RT-PCR检测tsRNA-26576表达水平”的分析思路。关于数据下载方式、文件组织格式、分析软件与参数设置等操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于小RNA测序与RT-PCR实验产生,样本量较小,仅包含四例癌症组织和四例相邻正常组织,可能限制统计效力与结论的普适性。差异表达分析鉴定出263个显著差异表达的tsRNA,其中75个上调、188个下调,但源站未提供这些tsRNA的完整列表、注释信息或统计阈值。此外,关于测序深度、重复性、批次效应控制、RT-PCR引物序列及内参选择等质量控制信息,源站未提供。因此,使用者在解释结果时需谨慎,避免过度推广至更广泛的乳腺癌人群。

【引用与许可】

该数据集的英文名称为“Small RNA sequencing reveals a novel tsRNA-26576 mediating tumorigenesis of breast cancer”,来源站为search.dataone.org。关于该数据集的引用格式、作者列表、发表期刊、DOI、许可协议及使用限制等信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应自行查阅来源站以获取完整的引用与许可要求。

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A4f7176f8f40b12d9f99e2f6549ee14f383ae555231d6f840ca0b473a03dfcb36

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的:作为一种发生于乳腺组织的恶性肿瘤,乳腺癌已被广泛认为是全球范围内威胁女性健康的最常见癌症类型。新出现的证据表明,tsRNAs可能在多种癌症的肿瘤发生和进展中发挥重要作用。然而,tsRNAs在乳腺癌中的功能在很大程度上仍不清楚。在此,我们研究了tsRNA-26576在乳腺癌肿瘤发生中的功能。患者与方法:在本研究中,采用小RNA测序评估了乳腺癌患者(4例癌组织和4例癌旁正常组织)中tsRNA的失调状态。随后,采用RT-PCR检测乳腺癌患者中tsRNA-26576的表达水平。结果:共鉴定出263个显著差异表达的tsRNAs,其中75个上调,188个下调。通过KEGG通路数据库进行的功能分类显示,最显著……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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