SiNuS:用于乳腺癌HER2分级的单核分割综合数据集

SiNuS 是面向乳腺癌 HER2 分级的单核分割数据集,基于 20× 双色原位杂交(Dual-ISH)图像,由三位专家病理学家独立标注 39 个图像块,覆盖 21 位患者,共得到 1,856 个 inclusive 与 1,284 个 exclusive 单核

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图像图像分割MicroscopyMolecular ImagingBreast CancerImage SegmentationIn Situ HybridizationHER2-Positive Breast CancerAutomated SegmentationMedical Image ProcessingDigital PathologyPathology of Breast CancerInstance Segmentation
SiNuS: A Comprehensive Dataset for Singular Nuclei Segmentation for HER2 Grading of Breast Cancer

基本信息

模态
图像
大小
0.119802523 GB
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

SiNuS:用于乳腺癌HER2分级的单核分割综合数据集

SiNuS: A Comprehensive Dataset for Singular Nuclei Segmentation for HER2 Grading of Breast Cancer

SiNuS 是面向乳腺癌 HER2 分级的单核分割数据集,基于 20× 双色原位杂交(Dual-ISH)图像,由三位专家病理学家独立标注 39 个图像块,覆盖 21 位患者,共得到 1,856 个 inclusive 与 1,284 个 exclusive 单核。数据提供二值、多色和边界掩码,可用于开发与评估单核分割及自动化 HER2 分级方法,是数字病理领域首个公开的此类资源(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集为双色原位杂交(Dual-ISH)乳腺癌图像(20×)中的单核分割提供经临床验证的标注,这些标注对于依据 ASCO/CAP 指南实现自动化 HER2 分级至关重要。三位专家病理学家独立标注了 39 个图像块,从 21 位患者中得到 1,856 个 inclusive 和 1,284 个 exclusive 单核。数据集包含二值、多色和边界掩码,是首个专门用于开发和评估数字病理中单核分割与 HER2 分级方法的公开资源。如果您使用该数据集,请引用以下论文:Hossain, Md Shakhawat, Md Sahilur Rahman, and Munim Ahmed. "SiNuS: A Comprehensive Dataset for Singular Nuclei Segmentation for HER2 Grading of Breast Cancer." Data in Brief (2026): 112934。

【主题与分类】

主题标签:Microscopy、Molecular Imaging、Breast Cancer、Image Segmentation、In Situ Hybridization、HER2-Positive Breast Cancer、Automated Segmentation、Medical Image Processing、Digital Pathology、Pathology of Breast Cancer。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/gtjrgwbntc

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源站:https://doi.org/10.17632/gtjrgwbntc

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 119.8 MB。

数据说明

该数据集为双染原位杂交(Dual-ISH)乳腺癌图像(20×)中的单核分割提供了经临床验证的标注,这对于依据ASCO/CAP指南进行自动化HER2分级至关重要。三位专家病理学家独立标注了39个图像块,从21位患者中获得了1,856个包含性单核和1,284个排他性单核。该数据集包含二值掩膜、多色掩膜和边界掩膜,是首个专门用于开发和评估数字病理学中单核分割与HER2分级方法的公开资源。如果您使用该数据集,请引用以下论文:Hossain, Md Shakhawat, Md Sahilur Rahman, and Munim Ahmed. “SiNuS: A Comprehensive Dataset for Singular Nuclei Segmentation for HER2 Grading of Breast Cancer.” Data in Brief (2026): 112934.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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