早期乳腺癌患者肠道微生物组与辅助化疗关系数据集

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦早期乳腺癌患者接受辅助化疗前后肠道微生物组的变化。数据采集化疗前 24 小时和化疗后 24 小时的新鲜粪便样本,通过 16S 测序分析肠道微生物组成及短期改变

Sun Yat-sen UniversitySun Yat-sen University
clinicaltrials
浏览 9
基因组预测Breast CancerAdjuvant Chemotherapy
Relationship Between Gut Microbiome and Adjuvant Chemotherapy in Patients With Early Breast Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

早期乳腺癌患者肠道微生物组与辅助化疗关系数据集

该数据集英文名为 Relationship Between Gut Microbiome and Adjuvant Chemotherapy in Patients With Early Breast Cancer,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类为肿瘤 / 乳腺癌,主题标签为 Breast Cancer 与 Adjuvant Chemotherapy。数据集聚焦早期乳腺癌患者接受辅助化疗前后肠道微生物组的变化:采集辅助化疗前 24 小时与化疗后 24 小时的新鲜粪便样本,通过 16S 测序分析肠道微生物的组成及后续短期改变。整体来看,该数据集围绕辅助化疗与肠道微生物组之间的关系展开,关注化疗前后微生物组成的短期动态,为理解辅助化疗过程中肠道微生态的变化提供样本层面的数据基础。

【数据集背景】

乳腺癌是女性最常见的癌症死亡原因。辅助化疗可显著降低高危乳腺癌的复发风险,但仍有约 30% 的患者在化疗后出现远处转移或局部复发;此外,60% 的患者在化疗期间出现 3-4 度药物不良反应。人体肠道微生物群被认为是与机体共生的重要微生态系统,被视为癌症发生与发展的关键决定因素之一,肠道微生物的改变还可能影响治疗疗效与药物不良事件。基于这一背景,该数据集旨在收集并分析早期乳腺癌患者辅助化疗前后肠道微生物组的变化,以探究肠道微生物组与辅助化疗之间的关系。

【数据内容】

数据集的核心内容是早期乳腺癌患者在接受辅助化疗前 24 小时与化疗后 24 小时采集的新鲜粪便样本,以及由此获得的肠道微生物组成和短期改变分析结果。分析手段为 16S 测序,用于刻画肠道微生物的组成及其在辅助化疗前后的短期变化。数据集主题标签为 Breast Cancer 与 Adjuvant Chemotherapy,本站分类为肿瘤 / 乳腺癌。除上述样本类型、采集时间点与 16S 测序分析外,源站未提供更细化的数据字段、样本量或测序平台信息。

【采集与来源】

数据来源于 clinicaltrials.gov。采集对象为接受辅助化疗的早期乳腺癌患者,采集样本为新鲜粪便,采集时间点为辅助化疗前 24 小时和辅助化疗后 24 小时,随后通过 16S 测序分析肠道微生物组成及后续短期改变。源站描述在此处未完整给出 16S 测序的具体方法细节,源站未提供更进一步的采集流程、样本保存与运输条件等信息。

【适用场景】

该数据集适用于围绕乳腺癌辅助化疗与肠道微生物组关系的研究场景,例如分析辅助化疗前后肠道微生物组成的短期变化、探讨肠道微生物改变与化疗疗效或药物不良事件之间的关联。其主题标签与分类也表明,该数据可用于肿瘤 / 乳腺癌方向下与辅助化疗相关的微生态研究。由于数据仅覆盖化疗前 24 小时与化疗后 24 小时两个时间点,其适用场景以短期变化的观察为主;源站未提供其他具体应用场景的说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、访问方式或分析流程说明。已知的分析路径为对化疗前后采集的新鲜粪便样本进行 16S 测序,并据此分析肠道微生物组成及短期改变;除此之外,源站未提供数据格式、下载方式或使用步骤等信息。

【质量与限制】

该数据集的采集时间点限定为辅助化疗前 24 小时与化疗后 24 小时,分析聚焦于肠道微生物组成及短期改变,因此其覆盖范围限于短期观察。源站描述在 16S 测序部分未完整给出后续细节,源站未提供样本量、测序深度、质量控制指标或数据完整性说明,也无法据此判断数据的代表性或偏倚情况。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

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免登录

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03702868

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:乳腺癌,辅助化疗。乳腺癌是女性癌症死亡最常见的原因。辅助化疗可显著降低高危乳腺癌的复发风险。然而,约30%的患者在化疗后仍出现远处转移或局部复发。此外,60%的患者在化疗期间出现3-4度药物不良反应。人类肠道微生物群被认为是与机体共生共存的最重要微生态系统,已被确定为癌症发生和发展的关键决定因素。此外,肠道微生物的改变可能影响治疗效果和药物不良事件。我们在辅助化疗前24小时和辅助化疗后24小时收集新鲜末端粪便样本,然后通过16S rRNA测序分析肠道微生物群的组成及随后的短期变化。本研究旨在探讨早期乳腺癌患者肠道微生物组与辅助化疗之间的关系。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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