乳腺癌中磷酸化诱导的构象与稳定性变化的蛋白质组范围表征
He Meng，乳腺癌中磷酸化诱导的构象与稳定性变化的蛋白质组范围表征[数据集]。主题标签：肿瘤、乳腺癌、蛋白质组、磷酸化、构象变化、稳定性变化
基本信息
资源简介
乳腺癌中磷酸化诱导的构象与稳定性变化的蛋白质组范围表征
Proteome-Wide Characterization of Phosphorylation-Induced Conformational and Stability Changes in Breast Cancer 是一个以乳腺癌为研究背景的蛋白质组学数据集，其英文名称直译为“乳腺癌中磷酸化诱导的构象与稳定性变化的蛋白质组范围表征”。该数据集由 He Meng 提交，收录于 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台，项目编号为 PXD007916。从主题上看，该数据集围绕肿瘤与乳腺癌展开，涉及蛋白质组、磷酸化、构象变化与稳定性变化等关键词，属于蛋白质组学与肿瘤生物学交叉领域的研究数据。整体而言，该数据集旨在支撑在蛋白质组尺度上考察磷酸化修饰如何影响蛋白质构象与稳定性这一研究方向，为相关领域的科研人员提供可检索与复用的数据资源。
【数据集背景】
蛋白质的磷酸化修饰是细胞信号传导中的关键调控方式之一，其不仅影响蛋白质的功能活性，也可能改变蛋白质的构象状态与结构稳定性。在肿瘤研究中，尤其是乳腺癌这类分子异质性显著的恶性肿瘤，磷酸化诱导的构象与稳定性变化可能与疾病相关的蛋白功能异常存在关联。该数据集正是在这一研究背景下产生，其标题明确指向“蛋白质组范围”的表征，意味着研究视角覆盖较大规模的蛋白质集合，而非局限于单一蛋白或少数通路。数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，进一步说明其应用语境集中于乳腺癌相关的分子机制研究。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括肿瘤、乳腺癌、蛋白质组、磷酸化、构象变化、稳定性变化，反映出其数据内容围绕磷酸化修饰引发的蛋白质构象与稳定性改变展开。数据集英文名称中的“Proteome-Wide Characterization”表明其内容定位于蛋白质组层面的系统性表征。关于具体的样本数量、蛋白鉴定数目、磷酸化位点数量、构象与稳定性测量指标等细节，源站未提供。数据的具体文件构成、格式与组织方式，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，具体收录于 PRIDE 归档平台，项目访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD007916。源站描述中标注的提交者为 He Meng。数据集的完整引用形式为：He Meng, Proteome-Wide Characterization of Phosphorylation-Induced Conformational and Stability Changes in Breast Cancer [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD007916。关于实验设计、样本来源、仪器平台、实验流程与数据处理方法等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题定位，该数据集可适用于乳腺癌相关的蛋白质组学研究，尤其是关注磷酸化修饰对蛋白质构象与稳定性影响的课题。研究人员可将其用于磷酸化诱导的结构变化相关假设的验证、蛋白质组层面数据的比较分析，或作为方法学研究中可复用的公共数据资源。由于数据集标注了肿瘤与乳腺癌分类，其潜在应用还包括肿瘤分子机制探索中的候选蛋白筛选与通路层面的关联分析。关于该数据集是否适用于特定分析流程或特定类型的计算工具，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台项目页面 PXD007916 进行访问与获取。关于数据下载的具体方式、文件格式说明、使用协议与配套分析指南，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由 PRIDE 归档平台收录，具备可追溯的项目编号与明确的提交者信息。关于数据质量评估指标、技术验证结果、样本规模与覆盖度、潜在的批次效应或技术偏差等信息，源站未提供。使用者在复用该数据时应结合自身研究目的审慎评估其适用性。
【引用与许可】
引用该数据集时，建议采用源站给出的引用形式：He Meng, Proteome-Wide Characterization of Phosphorylation-Induced Conformational and Stability Changes in Breast Cancer [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD007916。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD007916
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
He Meng, Proteome-Wide Characterization of Phosphorylation-Induced Conformational and Stability Changes in Breast Cancer [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD007916
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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