晚期乳腺癌高肿瘤分数ctDNA分析揭示芳香化酶抑制剂与CDK4/6抑制剂治疗特异性耐药机制的处理后数据
主题标签：乳腺癌、ctDNA、肿瘤分数、耐药机制、芳香化酶抑制剂、CDK4/6抑制剂、拷贝数分析、片段组学。本数据集为肿瘤领域公开数据集，由Zenodo提供，主题涵盖乳腺癌。
基本信息
资源简介
晚期乳腺癌高肿瘤分数ctDNA分析揭示芳香化酶抑制剂与CDK4/6抑制剂治疗特异性耐药机制的处理后数据
本数据集为一项针对晚期乳腺癌耐药机制研究的公开数据集，英文名称为“Processed data for High Tumor Fraction ctDNA Analysis Reveals Treatment-Specific Resistance Mechanisms for Aromatase Inhibitor and CDK4/6 Inhibitor in Advanced Breast Cancer”，由Zenodo发布，发布时间为2026年，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议。数据集主题涵盖乳腺癌、ctDNA、肿瘤分数、耐药机制、芳香化酶抑制剂、CDK4/6抑制剂、拷贝数分析及片段组学等方向，属于肿瘤/乳腺癌分类下的公开数据资源。该数据集汇集了相关研究中所使用的全部处理后数据，旨在为探索晚期乳腺癌中芳香化酶抑制剂与CDK4/6抑制剂治疗特异性耐药机制提供数据支撑，适合从事肿瘤基因组学、液体活检及乳腺癌耐药研究的科研人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集对应一篇题为“High Tumor Fraction ctDNA Analysis Reveals Treatment-Specific Resistance Mechanisms for Aromatase Inhibitor and CDK4/6 Inhibitor in Advanced Breast Cancer”的研究论文。研究聚焦于晚期乳腺癌中芳香化酶抑制剂和CDK4/6抑制剂的治疗特异性耐药机制，通过高肿瘤分数ctDNA分析手段展开探索。数据集由Hazelaar, Daan M.、Wortelboer, Noor、Jongbloed, Elisabeth M.、van Marion, Ronald、Ruigrok-Ritstier, Kirsten、de Weerd, Vanja、Kraan, Jaco、van Rossum-Schornage, Quirine C.、Heijns, Joan Barbara、Konings, Inge等作者共同贡献，机构为Zenodo。该数据集为论文中所有处理后数据的集合，便于研究者复现分析或开展后续研究。
【数据内容】
数据集包含以下处理后数据：IchorCNA染色体拷贝数分析结果；TSO500体细胞突变及局灶性拷贝数变异结果；Griffin片段组学分析结果；以及元数据。原始测序数据和临床数据可根据请求获取。此外，相关分析代码的GitHub仓库地址为https://github.com/daanhazelaar/sonia-resistance-ctdna。数据集覆盖了从拷贝数分析、体细胞突变检测到片段组学分析的多层次分子数据，为研究耐药机制提供了较为全面的处理后数据基础。
【采集与来源】
数据集来源站为doi.org，由Zenodo提供发布。原始测序数据与临床数据未直接包含在数据集中，需通过请求方式获取。处理后数据则直接公开，供研究社区使用。数据集的发布时间为2026年，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议，允许在署名条件下共享与使用。
【适用场景】
该数据集适用于晚期乳腺癌耐药机制研究，尤其是针对芳香化酶抑制剂与CDK4/6抑制剂的治疗特异性耐药分析。具体可应用于ctDNA肿瘤分数分析、染色体拷贝数变异研究、体细胞突变谱分析、片段组学特征探索等方向。对于从事液体活检、肿瘤基因组学、乳腺癌精准治疗及耐药机制研究的科研人员，该数据集可作为分析验证或二次挖掘的数据资源。同时，由于包含处理后数据及分析代码仓库链接，也适合用于方法学复现与比较研究。
【使用方法】
使用者可依据数据集中的IchorCNA拷贝数分析结果、TSO500体细胞突变与局灶性拷贝数变异结果、Griffin片段组学分析结果及元数据开展分析。分析代码可通过对应GitHub仓库获取。原始测序数据与临床数据需向数据提供方请求获取。使用时应遵守Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议，并适当引用相关论文与数据集。
【质量与限制】
数据集为处理后数据，原始测序数据与临床数据未直接公开，需请求获取，可能对部分需要原始数据的研究造成限制。数据集未提供样本量、具体突变数量、拷贝数变异数目等详细统计信息，源站未提供相关质量评估指标。使用者需结合自身研究目的评估数据适用性。此外，数据集发布时间为2026年，其长期维护与更新情况源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时，应遵循Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议，给予适当署名。引用时应参考对应论文“High Tumor Fraction ctDNA Analysis Reveals Treatment-Specific Resistance Mechanisms for Aromatase Inhibitor and CDK4/6 Inhibitor in Advanced Breast Cancer”及数据集本身。作者包括Hazelaar, Daan M.、Wortelboer, Noor、Jongbloed, Elisabeth M.、van Marion, Ronald、Ruigrok-Ritstier, Kirsten、de Weerd, Vanja、Kraan, Jaco、van Rossum-Schornage, Quirine C.、Heijns, Joan Barbara、Konings, Inge。机构为Zenodo。分析代码仓库地址为https://github.com/daanhazelaar/sonia-resistance-ctdna。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.20185908
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 353.0 MB。
数据说明
该数据集包含题为“高肿瘤分数ctDNA分析揭示晚期乳腺癌中芳香化酶抑制剂与CDK4/6抑制剂治疗特异性耐药机制”的手稿中所使用的全部处理数据。其中包括：IchorCNA染色体拷贝数分析结果、TSO500体细胞突变和局灶性拷贝数改变、Griffin片段组学分析结果、元数据。原始测序数据和临床数据可应要求提供。相应的分析代码GitHub仓库：https://github.com/daanhazelaar/sonia-resistance-ctdna
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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