AGO2 HITS-CLIP鉴定乳腺上皮细胞分化中的功能性miRNA并揭示Mmu-miR-122-5p在乳腺细胞发育和分化中的作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA940930

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数据说明

miRNA是一类长度平均为22个核苷酸的小型非编码RNA，以其在转录后基因调控中的作用而闻名，决定着任何生物体的细胞命运。miRNA的作用已被证明涉及从胚胎发育到个体组织水平分化的过程。它在转录后调节基因表达以执行乳腺发育和功能方面发挥着重要作用。近期研究突出了许多miRNA及其在乳腺癌中的致瘤作用。然而，关于miRNA在一般乳腺上皮细胞分化中的全面研究尚缺失。在本研究中，我们对乳腺上皮干细胞样细胞(HC11)进行了体外全局miRNA测序，以及高通量测序交联免疫沉淀(HITS-CLIP)以表征miRNA:mRNA相互作用。miRNA测序与HITS-CLIP的整合分析确定了在乳腺分化过程中最重要的调控miRNA及其对抑制细胞周期和细胞增殖途径的影响。

其中，miR-122-5p这一在乳腺上皮细胞未分化状态下转录后靶向基因数量最多的miRNA，被选中进行功能研究，以验证我们HITS-CLIP数据集的完整性。对miR-122的敲低研究表明，通过靶向Gys1，经Akt信号通路促进了细胞增殖，这阻碍了乳腺细胞的分化过程，并导致CASEIN表达下调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。