PRJNA494905:Count Me In 转移性乳腺癌项目
Count Me In - 转移性乳腺癌项目:一项旨在加速转移性乳腺癌研究的患者驱动研究计划。转移性乳腺癌项目是一项研究,通过社交媒体和倡导团体直接与转移性乳腺癌患者互动,并赋能他们通过分享样本和临床信息来加速癌症研究

基本信息
资源简介
PRJNA494905:Count Me In 转移性乳腺癌项目
PRJNA494905: Count Me In: The Metastatic Breast Cancer Project 是一个聚焦转移性乳腺癌的患者驱动研究项目,由患者通过社交媒体和倡导团体直接参与,旨在加速转移性乳腺癌研究。该项目鼓励患者分享其样本与临床信息,目标是建立一个公开可用的数据集,涵盖基因组、分子、临床及患者报告数据,以支持相关研究。项目面向美国或加拿大的患者开放在线注册,注册后需签署在线知情同意书,授权获取并分析其医疗记录、肿瘤组织、唾液和血液样本。入组患者会收到唾液采集套件并被要求寄回。该数据集在站内归类于肿瘤 / 乳腺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据集背景】
转移性乳腺癌是乳腺癌进展到晚期的阶段,相关研究需要大量患者样本与临床信息支撑。传统的科研模式往往依赖医疗机构被动收集数据,而该项目采取患者驱动的主动模式,通过社交媒体和倡导团体直接与转移性乳腺癌患者建立联系,赋能患者主动参与研究。项目的核心目标是加速转移性乳腺癌研究,通过构建公开可用的数据集,让更多研究者能够利用这些真实世界数据开展分析。该项目由患者直接参与推动,强调患者分享样本和临床信息对科研的加速作用。
【数据内容】
根据源站描述,该项目旨在创建一个公开可用的数据集,包含基因组、分子、临床和患者报告数据。这些数据类别覆盖了从分子层面到临床诊疗及患者自身体验的多维度信息,以支持转移性乳腺癌相关研究。具体的数据字段、变量数量、样本量、数据格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据采集以患者主动参与为基础。美国或加拿大的患者可以在线注册。注册患者会收到一份在线知情同意书,其中请求授权获取并分析其医疗记录、肿瘤组织、唾液和血液样本。一旦入组,患者会收到一个唾液采集套件,并被要求寄回。通过这一流程,项目从患者处直接获取生物样本与临床信息。关于采集的时间跨度、样本处理与测序平台、数据存储位置等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集的目标是支持转移性乳腺癌研究,公开可用的基因组、分子、临床和患者报告数据可供研究者用于探索疾病机制、分析临床特征与患者报告结局等研究方向。由于数据涵盖多类信息,潜在应用包括结合分子与临床数据的综合分析。具体的适用研究类型、分析方法和预期成果,源站未提供。
【使用方法】
源站描述提及该项目创建公开可用的数据集以支持研究,但未说明具体的数据访问流程、下载方式、使用协议或分析工具。关于如何申请、获取或使用该数据集,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述未提供关于数据质量、完整性、准确性、偏差或样本代表性的评估信息。该项目通过患者在线注册和主动分享样本与信息的方式收集数据,可能涉及患者自报数据与医疗记录的结合,但具体的质量控制措施与局限性,源站未提供。
【引用与许可】
源站描述未提供该数据集的引用格式、许可条款或使用限制。关于如何正确引用该数据集以及数据共享的许可条件,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA494905
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
加入我们——转移性乳腺癌项目:一项由患者驱动的研究倡议,旨在加速转移性乳腺癌研究。转移性乳腺癌项目是一项研究,通过社交媒体和倡导团体直接与转移性乳腺癌患者接触,并赋予她们通过分享样本和临床信息来加速癌症研究的能力。我们的目标是创建一个公开可用的数据集,包含基因组、分子、临床和患者报告的数据,以促进研究。美国和加拿大的患者可以在线注册。注册的患者会收到一份在线同意书,要求获得获取和分析其医疗记录、肿瘤组织、唾液和血液样本的许可。一旦入选,患者会收到一个唾液采集套件,并被要求邮寄……(更多内容请参见dbGaP研究页面。)
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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