PRJNA1516918:人乳腺癌细胞系RNA测序:CEBPB-TMEM160调控PI3K/AKT通路

BioProject 是围绕单一 initiative、来自单一组织或 consortium 的生物数据集合,该记录为用户提供一个单一位置,用于查找为该项目生成的多样数据类型链接(来源 NCBI)

sra
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基因组Raw sequence reads
PRJNA1516918: RNA-seq of human breast cancer cell lines: CEBPB-TMEM160 regulation of PI3K/AKT pathway

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1516918:人乳腺癌细胞系RNA测序:CEBPB-TMEM160调控PI3K/AKT通路

Homo sapiens (ID 1516918) - BioProject - NCBI

这是 NCBI BioProject 中标题为“Homo sapiens (ID 1516918)”的记录,标签为 Raw sequence reads。BioProject 是围绕单一 initiative、来自单一组织或 consortium 的生物数据集合,该记录为用户提供一个单一位置,用于查找为该项目生成的多样数据类型链接(来源 NCBI)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据,源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。

【主题与分类】

主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1516918

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1516918

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该 BioProject 包含来自人三阴性乳腺癌 SUM159 细胞系的双端原始 RNA-seq 读段。构建了 TMEM160 过表达和 TMEM160 敲低的稳定细胞模型及其相应的载体对照和 scramble 对照,用于转录组分析。转录组数据用于筛选差异表达基因,并揭示 TMEM160 介导的下游信号级联。GO 和 KEGG 富集分析显示其涉及 PI3K/AKT 信号通路和上皮-间质转化(EMT)。本研究旨在阐明 TMEM160 的致癌功能及其在乳腺癌进展中由转录因子 CEBPB 介导的转录激活。mRNA 文库由 Novogene Bioinformatics Institute 制备,并在 Illumina NovaSeq 平台上测序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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