PRJNA1514313:ZsGreen+与ZsGreen- 231乳腺癌细胞条件培养基诱导的巨噬细胞转录重编程

NCBI BioProject 编号 1514313:BioProject 汇集与单一计划相关的生物数据,可来自单一组织或联盟;其记录为用户提供单一入口,以查找该项目产生的多种数据类型链接

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1514313: Macrophage transcriptional reprogramming by conditioned media from ZsGreen+ and ZsGreen- 231 breast cancer cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1514313:ZsGreen+与ZsGreen- 231乳腺癌细胞条件培养基诱导的巨噬细胞转录重编程

ID 1514313 - BioProject - NCBI

NCBI BioProject 编号 1514313:BioProject 汇集与单一计划相关的生物数据,可来自单一组织或联盟;其记录为用户提供单一入口,以查找该项目产生的多种数据类型链接。源站标签为“Raw sequence reads”(来源 NCBI)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据,源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。

【主题与分类】

主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1514313

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1514313

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这引出了一个问题:anastatic细胞是否也通过升高GDF15来调节巨噬细胞功能。为解决这一问题,我们用来源于231-ZsGreen+或231-ZsGreen-细胞的条件培养基(CM)处理RAW264.7细胞,随后对这些细胞进行了RNA测序分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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