熊果酸处理与对照MDA-MB-231细胞的表达数据
数据可用于比较处理组与对照组之间的基因表达差异，服务于乳腺癌相关研究中的表达谱分析与候选基因筛选等用途（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
熊果酸处理与对照MDA-MB-231细胞的表达数据
该数据集为来源于 NCBI BioProject 数据库的一项肿瘤/乳腺癌相关项目，英文名称为“PRJNA1502529: Expression data from ursolic acid-treated versus control MDA-MB-231 cells”。从名称可知，其内容涉及熊果酸处理组与对照组 MDA-MB-231 细胞的表达数据，属于人类（Homo sapiens）来源。项目编号为 1502529，主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长。该数据集可用于比较处理组与对照组之间的基因表达差异，服务于乳腺癌相关研究中的表达谱分析与候选基因筛选等用途。整体而言，该数据集为乳腺癌细胞在特定化合物干预下的表达谱研究提供了原始测序数据基础，适合开展转录层面的差异分析与后续候选基因挖掘。
【数据集背景】
该数据集对应 NCBI BioProject 数据库中的一条项目记录，项目编号为 1502529，物种来源为 Homo sapiens。BioProject 是围绕某一项研究计划或联盟所产生的一组生物学数据的集合，其记录为用户提供统一入口，以便查找该项目所生成的多种数据类型。该项目的英文名称明确指向“ursolic acid-treated versus control MDA-MB-231 cells”的表达数据，说明其研究背景围绕熊果酸处理与未处理乳腺癌细胞之间的表达差异展开。本站将其归类为肿瘤/乳腺癌方向，主题标签为“Raw sequence reads”，表明该项目的核心数据形式为原始序列读长。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长。数据集名称表明其内容为熊果酸处理组与对照组 MDA-MB-231 细胞的表达数据。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长长度、数据量、基因数量或具体表达指标等更详细的内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1502529，物种为 Homo sapiens。项目名称显示其涉及熊果酸处理与对照条件下的 MDA-MB-231 细胞。除这些来源与物种信息外，源站未提供关于采集时间、采集地点、实验操作流程、测序建库方法或具体机构等更多细节。
【适用场景】
根据侧写线索，该数据可用于比较处理组与对照组之间的基因表达差异，服务于乳腺癌相关研究中的表达谱分析与候选基因筛选等用途。具体而言，可围绕熊果酸干预后 MDA-MB-231 细胞的表达变化开展差异表达分析，并在此基础上筛选候选基因，为乳腺癌相关机制研究或后续验证提供数据支持。除上述用途外，源站未提供其他适用场景。
【使用方法】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其提供的是原始序列读长。使用者可基于原始读长开展后续分析，例如与参考基因组比对、表达定量以及处理组与对照组之间的差异比较。由于源站未提供具体的分析流程、参考基因组版本、标准化方法或软件参数，相关操作需依据通用转录组分析规范自行确定。源站未提供关于数据下载方式、文件格式或处理步骤的进一步说明。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1502529，主题标签为“Raw sequence reads”。源站未提供关于数据质量评分、测序深度、重复次数、批次效应、污染控制或验证实验等信息。因此，在解释处理组与对照组之间的表达差异时，应结合原始数据质量评估与实验设计信息加以判断。源站未提供关于该数据集局限性的具体说明。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录，项目编号为 1502529。源站未提供关于引用格式、许可条款、使用限制或数据共享政策的详细信息。使用者在引用或再利用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 来源页面的相关说明。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1502529
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：熊果酸是一种天然五环三萜类化合物，据报道具有多种药理活性，包括抗癌特性。然而，其对MDA-MB-231三阴性乳腺癌细胞全局转录组谱的影响仍未完全阐明。方法：将MDA-MB-231细胞以每孔3 x 10^5个细胞的密度接种于6孔板中，并用25 uM熊果酸或溶剂对照（0.1% DMSO）处理12小时。每个处理组包含3个生物学重复。处理后，用预冷的PBS洗涤细胞，收集细胞，并在-80 C下速冻。提取总RNA并进行文库构建。由Lc-Bio Technologies (Hangzhou) Co., Ltd.（中国杭州）在Illumina Novaseq 6000平台上进行双端测序（150 bp）。原始reads经过质量过滤，并使用HISAT2比对到人类参考基因组（GRCh38）。使用StringTie以FPKM量化基因表达水平。使用DESeq2对熊果酸处理组与对照组进行差异表达分析。
功能富集分析通过在线平台OmicStudio（www.omicstudio.cn）进行。结果：该数据集提供了一个全面的转录组资源，用于识别MDA-MB-231细胞中对熊果酸响应的基因和通路，这可能有助于理解其在乳腺癌中的分子机制，包括对凋亡、细胞周期调控及其他癌症相关过程的潜在影响。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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