PRJNA1484801:HER2阳性乳腺癌

BioProject 记录汇集了由单一机构或联合体发起的同一项计划所产生的多种生物数据,并提供统一入口链接到该项目生成的不同数据类型

sra
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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1484801: HER2-positive breast cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1484801:HER2阳性乳腺癌

PRJNA1484801 是一个围绕 HER2 阳性乳腺癌的 BioProject 记录,归属于肿瘤 / 乳腺癌分类,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录形式,该计划可来自单一机构或联合体。此类记录为用户提供统一入口,便于定位同一项目所生成的不同数据类型。该数据集的主题标签为原始测序读段(Raw sequence reads),表明其关联数据以测序读段形式呈现。整体而言,该记录是 NCBI BioProject 体系中针对 HER2 阳性乳腺癌研究计划的数据入口,用于串联该项目产生的多种生物数据,帮助用户从项目层面了解并获取相关数据资源。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 数据库中的一条记录,源站标题为“ID 1484801 - BioProject - NCBI”,英文名称为“PRJNA1484801: HER2-positive breast cancer”。BioProject 的定位是汇集与单一研究计划相关的生物数据,该计划可源自单一组织,也可源自一个联合体。BioProject 记录的核心作用,是为用户提供一个统一的位置,以查找该项目所生成的不同数据类型之间的链接。因此,该数据集的背景并非单一实验或单一文件,而是一个以 HER2 阳性乳腺癌为主题的研究计划层级的数据组织单元。本站将其归入肿瘤 / 乳腺癌分类,主题标签为原始测序读段,说明该计划涉及以测序读段形式产出的数据。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,即原始测序读段。BioProject 记录本身并不等同于某一类具体数据文件,而是提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接入口。就本记录而言,其关联的数据类型以原始测序读段为标签。源站描述指出,BioProject 记录使用户能够在一个统一位置找到该项目产生的多种数据类型。除上述信息外,关于该项目的具体样本数量、测序平台、读段长度、数据量、基因或变异信息等内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录标识为 BioProject ID 1484801。根据源站描述,BioProject 可起源于单一组织或联合体,用于汇集与单一计划相关的生物数据。该记录的主题标签为原始测序读段,表明其关联数据属于测序产出的原始读段类型。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、受试者信息、具体研究机构名称等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可作为查找 HER2 阳性乳腺癌相关研究计划数据的入口,适用于需要从项目层级了解并获取该项目所生成的不同数据类型链接的用户。由于主题标签为原始测序读段,其关联数据可用于需要原始测序读段的生物信息学分析场景。BioProject 的统一入口特性,也便于用户在同一记录下定位该项目产生的多种数据类型。关于该数据集在临床诊断、药物研发、预后评估等方面的具体适用性,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1484801 访问该项目的统一入口,并经由该入口查找该项目所生成的不同数据类型的链接。该记录的主题标签为原始测序读段,用户可据此定位以原始测序读段形式呈现的关联数据。关于具体的下载方式、数据格式、分析流程、软件工具或访问权限要求,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录,其作用是汇集与单一计划相关的生物数据并提供统一链接入口,而非对数据质量进行评价或保证。源站描述未提供关于数据质量、覆盖度、完整性、准确性或技术偏倚的信息。该记录的主题标签为原始测序读段,但关于读段质量、污染情况、重复率等具体指标,源站未提供。此外,关于该项目的样本量、数据规模、更新频率及版本信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“ID 1484801 - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1484801

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Pre- and post-neoadjuvant TCHP treatment FFPE tissue specimens from HER2-positive breast cancer patients

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