基本信息

模态

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1478702：拉米夫定在雌激素驱动乳腺癌大鼠模型中的疗效测试

该数据集为 NCBI BioProject 编号 1478702 的项目记录，英文名称为“Testing therapeutic effects of lamivudine in the estrogen-driven breast cancer rat model.”，中文含义为在雌激素驱动的乳腺癌大鼠模型中测试拉米夫定的治疗效果。从分类上看，该数据集归属于肿瘤 / 乳腺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads）。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集而成的生物数据集合，通常由单一机构或联合体发起，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。因此，该数据集的核心价值在于将拉米夫定治疗与雌激素驱动的乳腺癌大鼠模型这一研究主题相关的原始测序数据集中呈现，便于后续检索、关联与再利用。

【数据集背景】

该数据集对应的研究主题是评估拉米夫定在雌激素驱动的乳腺癌大鼠模型中的治疗效果。乳腺癌是肿瘤学中的重要研究方向，而雌激素驱动的大鼠模型常被用于模拟与激素相关的乳腺癌发生与发展过程。拉米夫定作为一种已知药物，在该研究背景下被用于测试其治疗效应。该 BioProject 记录正是围绕这一研究计划而建立，用于汇集该项目产生的生物数据。源站未提供该研究的具体立项背景、研究机构、资助来源以及实验假设的详细说明。

【数据内容】

该数据集的主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads），表明其数据内容主要涉及测序产生的原始读段数据。BioProject 记录本身并不限定单一数据类型，而是提供指向该项目所生成多种数据类型的链接入口。因此，该数据集可被理解为围绕“拉米夫定治疗雌激素驱动乳腺癌大鼠模型”这一研究计划所组织的原始测序读段集合。源站未提供样本数量、测序平台、读段长度、数据量、文件格式以及具体组别设计等信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1478702。BioProject 作为生物数据集合的记录形式，通常来自单一组织或联合体，旨在为用户提供查找该项目相关数据的统一位置。该数据集被本站归类为肿瘤 / 乳腺癌方向，主题标签为原始测序读段。源站未提供样本采集地点、采集时间、动物品系、伦理审批信息以及具体实验操作流程。

【适用场景】

该数据集适用于与乳腺癌、尤其是雌激素驱动乳腺癌大鼠模型相关的研究场景，也可用于关注拉米夫定治疗效果评估的探索性分析。由于主题标签为原始测序读段，该数据可用于需要从原始测序层面进行重新分析、比对或整合的研究工作。同时，作为 BioProject 记录，它也可作为查找该项目所产生多种数据类型及其关联资源的入口。源站未提供该数据集在具体疾病机制、药物作用通路或临床转化方面的适用性说明。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 编号 1478702 在 ncbi.nlm.nih.gov 上定位该记录，并借助 BioProject 提供的链接入口查找该项目所生成的不同数据类型。由于该数据集的主题标签为原始测序读段，使用时可重点关注原始测序读段相关数据。源站未提供具体的下载方式、数据处理流程、分析工具建议以及配套元数据字段说明。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开数据库中的项目记录。其主题标签为原始测序读段，说明数据内容以原始测序读段为主。源站未提供关于数据质量评估、测序深度、覆盖度、批次效应、样本重复数以及潜在偏差的具体信息。此外，该记录为 BioProject 层面的汇总入口，源站未提供该项目下各数据类型的完整清单与详细技术参数。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录，项目编号为 1478702。源站未提供具体的引用格式、许可条款、使用限制以及数据共享政策。使用者在引用或再利用该数据集时，应自行查阅源站页面以获取最新的引用与许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1478702

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1478702

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们采用ACI大鼠自发性雌激素驱动乳腺癌模型，研究癌症发展的最早期阶段以及拉米夫定（3TC）的作用。总体设计：将大鼠植入2.5或7.5毫克雌激素（E2）或安慰剂缓释颗粒，并在饮用水中给予15毫克/毫升的3TC治疗6个月，或不予治疗。对各组大鼠的乳腺和PBMC进行了批量RNA测序（RNAseq）分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别