GPR19敲低人乳腺癌细胞系转录组分析
该数据集为 NCBI BioProject 收录的 GPR19 敲低人乳腺癌细胞系转录组分析项目，主题标签为 Raw sequence reads，属于肿瘤/乳腺癌研究范畴
基本信息
资源简介
GPR19敲低人乳腺癌细胞系转录组分析
PRJNA1474259 是 NCBI BioProject 收录的一个转录组分析项目，全称为“Transcriptome profiling of GPR19-knockdown human breast cancer cell lines”，即针对 GPR19 敲低的人乳腺癌细胞系开展转录组分析的研究项目。该项目在 NCBI BioProject 数据库中的编号为 1474259，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向，主题标签为 Raw sequence reads。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集生物数据的记录形式，通常来源于单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以链接该项目所产生的多种数据类型。该数据集的核心内容围绕 GPR19 基因敲低后的人乳腺癌细胞系转录组展开，属于乳腺癌分子机制研究中的基因表达谱分析范畴。
【数据集背景】
该数据集对应的研究计划聚焦于 GPR19 敲低的人乳腺癌细胞系，旨在通过转录组分析获取基因表达层面的数据。GPR19 是一个受体相关基因，在乳腺癌细胞系中对其进行敲低后开展转录组测序，可用于观察基因表达变化。该 BioProject 记录由 NCBI 收录，属于肿瘤 / 乳腺癌研究领域。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，来源于单一组织或联合体，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。该项目的主题标签为 Raw sequence reads，表明其数据以原始序列读段的形式呈现。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始序列读段。项目名称为“Transcriptome profiling of GPR19-knockdown human breast cancer cell lines”，说明其数据内容为 GPR19 敲低人乳腺癌细胞系的转录组分析所产生的原始测序读段。除此之外，关于样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等具体内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，BioProject 编号为 1474259。其标题为“ID 1474259 - BioProject - NCBI”。项目所涉及的研究对象为 GPR19 敲低的人乳腺癌细胞系，数据类型为原始序列读段。关于样本采集的具体方法、细胞系来源、培养条件、敲低手段、测序建库流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤 / 乳腺癌相关研究，尤其是围绕 GPR19 基因敲低后转录组变化的分析场景。由于主题标签为 Raw sequence reads，其原始序列读段可用于转录组层面的基因表达分析、差异表达分析等常规下游处理。此外，该数据也可作为乳腺癌细胞系转录组研究的数据资源，用于与其它乳腺癌相关转录组数据进行比较或整合分析。关于该数据集是否适用于特定分析流程或特定研究问题，源站未提供进一步说明。
【使用方法】
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，用户可通过 BioProject 编号 1474259 在 NCBI 平台上查找该项目及其关联的数据类型。BioProject 记录提供统一入口，用于链接该项目所产生的多种数据。由于主题标签为 Raw sequence reads，使用者通常需要获取原始序列读段后，依据转录组分析的一般流程进行后续处理。关于具体的下载方式、数据处理步骤、推荐工具或分析参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开收录的研究项目记录。其主题标签为 Raw sequence reads，表明数据以原始读段形式提供，通常需要使用者自行进行质量控制与后续分析。关于该数据集的质量评估指标、数据完整性、是否存在批次效应、样本量是否充分等具体信息，源站未提供。使用者在使用时应结合项目背景与自身研究目的进行判断。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 1474259，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或授权信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1474259
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含源自人乳腺癌细胞系MDA-MB-231和BT-549在GPR19敲低后的转录组测序数据。通过RNA-seq分析，旨在表征与GPR19缺失相关的全局基因表达变化。这些数据旨在支持识别乳腺癌细胞中由GPR19调控的差异表达基因和信号通路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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