基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

MDA-MB-231与MCF7细胞经MDA条件培养基及厄洛替尼处理数据集

该数据集为 NCBI BioProject 收录的乳腺癌细胞研究项目，编号 1473975，英文名称为“MDA-MB-231 and MCF7 Cells Treated with MDA Conditioned Media with and without Erlotinib Treatment”。项目围绕 MDA-MB-231 与 MCF7 两种乳腺癌细胞系展开，核心实验条件为使用 MDA 条件培养基进行处理，并在此基础上设置加入厄洛替尼与不加入厄洛替尼的对照。数据主题标签为“Raw sequence reads”，表明其内容属于原始测序读长类型。该数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，适合关注乳腺癌细胞行为、条件培养基刺激以及厄洛替尼干预相关研究的人员检索与使用。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，源站标题为“ID 1473975 - BioProject - NCBI”。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目集合形式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据，这些数据通常来自单一机构或联合体。一个 BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的不同类型的数据。该数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据形态以原始测序读长为主。项目名称明确指向 MDA-MB-231 与 MCF7 两种细胞系，并涉及 MDA 条件培养基处理以及厄洛替尼处理的有无设置。源站未提供该研究的具体立项背景、科学假设或研究目的。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其包含的数据类型为原始序列读长。项目名称显示，研究对象为 MDA-MB-231 与 MCF7 两种细胞系，处理条件包括 MDA 条件培养基，并在此基础上设置加入厄洛替尼与不加入厄洛替尼两种情形。因此，从数据组织角度看，该数据集应涵盖上述细胞系在相应处理条件下的测序读长数据。源站未提供样本数量、测序平台、读长长度、数据量、文件格式或具体分组细节。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1473975 - BioProject - NCBI”。其英文名称为“PRJNA1473975: MDA-MB-231 and MCF7 Cells Treated with MDA Conditioned Media with and without Erlotinib Treatment”。项目记录归属于 NCBI BioProject 体系，该体系用于汇集与单一研究计划相关的生物数据，并提供一个统一查找入口。源站未提供具体提交机构、研究团队、样本采集时间、细胞培养条件或测序实验的详细流程。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌相关研究场景，尤其是涉及 MDA-MB-231 与 MCF7 细胞系、MDA 条件培养基处理以及厄洛替尼干预的研究。由于主题标签为“Raw sequence reads”，其原始测序读长可用于后续转录组或其他序列层面的分析。该数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，因此也可作为乳腺癌细胞模型相关数据检索与比较的参考。源站未提供该数据集在特定分析流程、疾病模型或临床转化中的具体应用说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问，项目编号为 1473975，英文名称为“PRJNA1473975: MDA-MB-231 and MCF7 Cells Treated with MDA Conditioned Media with and without Erlotinib Treatment”。用户可通过 BioProject 记录查找与该项目相关的不同类型数据。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用时可依据原始测序读长进行后续处理。源站未提供具体的下载方式、数据处理步骤、分析工具或质量控制参数。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1473975 - BioProject - NCBI”。其主题标签为“Raw sequence reads”，表明数据以原始测序读长形式提供。项目名称明确了细胞系与处理条件，包括 MDA-MB-231 与 MCF7 细胞系、MDA 条件培养基处理以及厄洛替尼处理的有无。源站未提供数据质量评估指标、覆盖度、重复次数、批次信息或潜在偏差说明。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1473975 - BioProject - NCBI”，英文名称为“PRJNA1473975: MDA-MB-231 and MCF7 Cells Treated with MDA Conditioned Media with and without Erlotinib Treatment”。源站未提供具体的引用格式、许可条款或使用限制说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1473975

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1473975

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MCF7人乳腺癌细胞在体外培养，并使用从MDA-MB-231三阴性乳腺癌细胞收集的条件培养基进行处理。处理后的细胞提取RNA进行批量RNA测序，以评估旁分泌信号诱导的转录变化。未处理的MCF7细胞作为对照。在部分实验条件下，细胞接受厄洛替尼与条件培养基联合处理，或在暴露前接受厄洛替尼处理，以评估在条件培养基刺激下EGFR抑制的转录效应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别