GPR19 通过 ERK 依赖的 FOXM1 激活驱动 p53 突变乳腺癌细胞周期进展

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1467881),主题为 GPR19 通过 ERK 依赖的 FOXM1 激活驱动 p53 突变乳腺癌细胞周期进展,属于肿瘤/乳腺癌研究范畴

sra
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时间序列Raw sequence reads
PRJNA1467881: GPR19 Drives Cell Cycle Progression via ERK-Dependent FOXM1 Activation in p53-Mutant Breast Cancer

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

GPR19 通过 ERK 依赖的 FOXM1 激活驱动 p53 突变乳腺癌细胞周期进展

PRJNA1467881 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物研究项目记录,其研究主题为 GPR19 通过 ERK 依赖的 FOXM1 激活驱动 p53 突变乳腺癌细胞周期进展。该数据集归属于肿瘤 / 乳腺癌研究范畴,主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads)。作为 BioProject 体系下的一项记录,它为使用者提供了一个集中入口,用以查找围绕该单一研究计划所产生的多种类型数据及其相关链接。该项目聚焦于 GPR19 在 p53 突变型乳腺癌中的作用机制,涉及 ERK 信号通路与 FOXM1 转录因子的激活关系,以及其对细胞周期推进的影响,适合关注乳腺癌分子机制、信号转导与细胞周期调控的研究人员参考使用。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式,用于汇集与某一项单一研究计划相关的生物学数据。按照 NCBI 的说明,一个 BioProject 通常源自单一机构或某一联合体,其记录为用户提供一个统一的位置,以便找到该项目所产生的各类数据类型的链接。PRJNA1467881 即属于此类记录,其研究主题围绕 GPR19 在 p53 突变乳腺癌中的作用展开,具体涉及 GPR19 通过 ERK 依赖的方式激活 FOXM1,进而驱动细胞周期进展这一机制方向。该主题使其被归入肿瘤 / 乳腺癌这一研究领域。

【数据内容】

该数据集的主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),表明其数据内容涉及测序产生的原始读段数据。项目所对应的研究主题为 GPR19 通过 ERK 依赖的 FOXM1 激活驱动 p53 突变乳腺癌细胞周期进展。除上述主题标签与研究方向外,关于具体样本数量、测序平台、读段长度、数据量、文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“ID 1467881 - BioProject - NCBI”。其数据依托 NCBI BioProject 体系进行组织与发布,BioProject 记录本身提供指向该项目所生成各类数据的链接入口。关于样本采集地点、采集时间、实验操作流程、建库方法等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其研究主题与分类,该数据集适用于肿瘤学特别是乳腺癌相关研究,尤其是关注 p53 突变背景下信号通路机制的方向。具体而言,可用于探讨 GPR19 与 ERK 信号通路、FOXM1 激活以及细胞周期进展之间关系的分析场景。由于主题标签为原始序列读段,该数据也可能适用于转录组或相关测序数据的再分析。关于更具体的适用分析类型或推荐应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录(ID 1467881)进行访问,BioProject 记录为用户提供查找该项目所产生各类数据的链接入口。关于数据下载方式、预处理步骤、分析流程或配套工具等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开的生物研究项目记录。关于数据质量评估指标、覆盖度、潜在偏差、技术限制或使用注意事项等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“ID 1467881 - BioProject - NCBI”。关于具体的引用格式、许可条款或使用限制等信息,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1467881

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

GPR19是一种孤儿G蛋白偶联受体,与乳腺癌具有潜在相关性。本研究通过分析公共数据集、临床样本、乳腺癌细胞模型、RNA测序数据、ERK救援实验以及异种移植模型,探讨了GPR19在TP53突变型乳腺癌中的作用。结果显示,GPR19在TP53突变型乳腺癌和三阴性乳腺癌中高表达,且GPR19高表达与不良预后相关。敲低GPR19可抑制乳腺癌细胞增殖、集落形成和DNA合成,同时诱导G2-M期细胞周期阻滞和凋亡。在机制上,GPR19促进ERK磷酸化,维持FOXM1表达,并激活下游细胞周期调控因子CCNB1和PLK1。ERK激活可部分挽救GPR19敲低所导致的影响。体内实验进一步证实,敲低GPR19通过抑制ERK-FOXM1信号轴来抑制肿瘤生长。这些发现表明,GPR19是TP53突变型乳腺癌中潜在的致癌驱动因子和治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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