谷胱甘肽S-转移酶介导双金属纳米簇自组装增强cGAS-STING激活与免疫微环境重塑抑制乳腺癌进展

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1466744),主题为谷胱甘肽S-转移酶介导的双金属纳米簇自组装,通过增强cGAS-STING激活与免疫微环境重塑来抑制乳腺癌进展

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基因组Raw sequence reads
PRJNA1466744: Glutathione S-Transferase-Mediated Self-Assembly of Bimetallic Nanoclusters Enhances cGAS-STING Activation and Immune Microenvironment Remodeling for Inhibiting Breast Cancer Progression

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

谷胱甘肽S-转移酶介导双金属纳米簇自组装增强cGAS-STING激活与免疫微环境重塑抑制乳腺癌进展

PRJNA1466744 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录,标题为“Glutathione S-Transferase-Mediated Self-Assembly of Bimetallic Nanoclusters Enhances cGAS-STING Activation and Immune Microenvironment Remodeling for Inhibiting Breast Cancer Progression”。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为原始测序读段(Raw sequence reads)。从标题可以看出,该项目围绕谷胱甘肽S-转移酶介导的双金属纳米簇自组装展开,研究其增强cGAS-STING激活、重塑免疫微环境,进而抑制乳腺癌进展的作用。该记录为使用者提供了一个集中入口,用以查找与这一研究计划相关的多种数据类型。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 1466744。BioProject 是围绕某一项研究计划而组织的生物数据集合,这些计划通常由单一机构或联合体发起。BioProject 记录的作用是为用户提供一个统一的位置,以便找到该项目所产生的不同类型的数据。本项目的科学背景聚焦于乳腺癌研究,具体涉及谷胱甘肽S-转移酶介导的双金属纳米簇自组装,以及该过程对cGAS-STING通路激活和免疫微环境重塑的影响,最终指向抑制乳腺癌进展这一目标。本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌领域。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其包含原始测序读段数据。项目标题所描述的研究内容涉及双金属纳米簇的自组装、cGAS-STING激活、免疫微环境重塑以及乳腺癌进展抑制等方向。除上述信息外,源站未提供关于数据内容的具体细节,例如样本数量、测序平台、读段长度、数据量或具体文件格式等。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“ID 1466744 - BioProject - NCBI”。项目由单一机构或联合体发起,属于 NCBI BioProject 体系下的记录。关于样本采集的具体方法、采集时间、采集地点、实验条件以及机构名称等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与乳腺癌相关的肿瘤学研究,尤其是涉及谷胱甘肽S-转移酶、双金属纳米簇、cGAS-STING通路、免疫微环境重塑等方向的分析工作。由于主题标签为原始测序读段,其可能用于转录组或其他测序相关的数据分析。然而,源站未提供关于具体适用场景的进一步说明,使用者应结合自身研究目的判断其可用性。

【使用方法】

源站未提供关于该数据集使用方法的说明,包括数据下载方式、预处理流程、分析工具或参考基因组等信息。使用者可访问 NCBI BioProject 记录页面,通过项目编号 1466744 查找与该计划相关的数据链接。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、覆盖度、测序深度或潜在偏差等信息。由于缺乏具体的技术细节和质控指标,使用者在采用该数据前应自行评估其适用性和可靠性。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款等信息。使用者应参考 NCBI BioProject 的通用政策以及项目相关出版物的要求进行引用和合规使用。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1466744

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

免疫原性细胞死亡(ICD)诱导和免疫微环境重塑对于实现乳腺癌治疗的持久应答至关重要。在本研究中,我们开发了一种谷胱甘肽S-转移酶(GST)调控的自组装方法,构建了由谷胱甘肽稳定的超小金-银纳米簇(AuAg NCs),作为协同光热-免疫治疗的多功能纳米平台。该纳米簇表现出强烈的近红外光热性能和类过氧化物酶催化活性,能够在激光照射下增强细胞内活性氧生成并有效诱导ICD。机制上,该治疗激活了cGAS-STING信号通路,并促进了免疫刺激性损伤相关分子模式的释放,包括ATP和HMGB1。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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