STAT3干扰驱动纳米调节剂逆转脂质代谢相关化疗耐药并增强乳腺癌金属免疫治疗_4T1乳腺癌细胞,NiS@ALB处理

数据主题标签为 Raw sequence reads,属于肿瘤/乳腺癌分类。项目围绕 STAT3 干扰驱动的纳米调节剂逆转脂质代谢相关化疗耐药并增强金属免疫治疗这一研究方向产生

sra
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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1446736: STAT3 interference-driven nanomodulators reverse lipid metabolism-associated chemoresistance and potentiate metalloimmunotherapy in breast cancer_4T1 breast cancer cells, treated with NiS@ALB

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

STAT3干扰驱动纳米调节剂逆转脂质代谢相关化疗耐药并增强乳腺癌金属免疫治疗_4T1乳腺癌细胞,NiS@ALB处理

PRJNA1446736 是一个围绕乳腺癌化疗耐药与金属免疫治疗研究的生物项目数据集,其英文全称为 STAT3 interference-driven nanomodulators reverse lipid metabolism-associated chemoresistance and potentiate metalloimmunotherapy in breast cancer_4T1 breast cancer cells, treated with NiS@ALB。该数据集在 NCBI BioProject 数据库中登记,编号为 1446736,本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向。从主题标签来看,该数据集属于 Raw sequence reads 类型,即包含原始测序读长数据。项目整体聚焦于 STAT3 干扰驱动的纳米调节剂如何逆转与脂质代谢相关的化疗耐药,并增强金属免疫治疗的效果,研究对象为经 NiS@ALB 处理的 4T1 乳腺癌细胞。该数据集为相关领域研究者提供了来自特定实验条件下的原始测序数据资源,有助于深入探索乳腺癌治疗抵抗机制及新型纳米免疫治疗策略。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库,该数据库是一个汇集与单一研究计划相关的生物学数据的资源库,这些数据通常来自单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一的入口,用以查找该项目所产生的多种数据类型。本项目的研究背景涉及乳腺癌治疗中的关键难题,即化疗耐药问题。具体而言,项目名称揭示了其研究核心:STAT3 干扰驱动的纳米调节剂能够逆转与脂质代谢相关的化疗耐药,并增强金属免疫治疗的效果。研究对象为 4T1 乳腺癌细胞,处理条件为 NiS@ALB。这一研究方向结合了纳米技术、免疫治疗与代谢调控,属于肿瘤学与生物医学交叉的前沿领域。本站将该数据集分类为肿瘤 / 乳腺癌,进一步明确了其应用领域。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,表明其包含的是原始测序读长数据。这些数据是在对 4T1 乳腺癌细胞进行 NiS@ALB 处理并涉及 STAT3 干扰的实验条件下产生的。原始测序读长通常可用于后续的转录组分析、基因表达定量、差异表达分析以及通路富集等研究。然而,关于具体的测序平台、读长长度、数据量、样本数量、生物学重复数等详细信息,源站未提供。此外,数据集是否包含其他类型的数据(如处理后分析结果、注释文件等),源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体记录为 BioProject ID 1446736。BioProject 作为生物学数据的集合,其记录通常关联来自单一研究计划或联盟的多种数据类型。本项目的英文名称明确指出了实验涉及的因素:STAT3 干扰、纳米调节剂、脂质代谢相关化疗耐药、金属免疫治疗、4T1 乳腺癌细胞以及 NiS@ALB 处理。这些信息构成了数据采集的实验背景。但关于样本采集的具体时间、地点、操作流程、伦理审批信息以及测序服务的提供方等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤学、乳腺癌研究、纳米医学、免疫治疗以及代谢与耐药机制研究等领域。具体而言,研究者可以利用这些原始测序读长数据来探索 STAT3 干扰如何影响脂质代谢相关基因的表达,进而揭示化疗耐药的分子机制。同时,该数据也可用于评估 NiS@ALB 纳米调节剂对 4T1 乳腺癌细胞转录组的影响,以及金属免疫治疗增强效应的潜在通路。此外,该数据集可作为乳腺癌化疗耐药与免疫治疗联合策略研究的参考数据,用于比较分析或整合分析。对于从事纳米药物开发、免疫微环境调控以及 RNA 测序数据分析的研究人员,该数据集具有潜在的利用价值。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录的形式提供,用户可通过 NCBI 的 BioProject 数据库访问。由于主题标签为 Raw sequence reads,用户通常需要下载原始测序数据(如 FASTQ 格式文件),然后使用标准的生物信息学工具进行质控、比对、定量和差异表达分析。具体的数据下载链接、文件格式、大小以及是否提供处理后的数据矩阵,源站未提供。用户应参考 NCBI BioProject 页面的具体说明以及相关 SRA(Sequence Read Archive)记录来获取数据。此外,由于数据集涉及特定实验条件,用户在使用时应仔细阅读项目描述,确保分析条件与实验设计相匹配。

【质量与限制】

该数据集的质量控制信息、测序深度、覆盖度、重复性以及潜在的批次效应等,源站未提供。用户在使用原始测序读长时,需自行进行质量评估和过滤。此外,由于数据集仅涉及 4T1 乳腺癌细胞系和 NiS@ALB 处理条件,其结果的外推性可能受限于特定细胞模型和实验设置。关于数据是否经过同行评审、是否有相关发表论文支持以及是否存在已知的技术偏差,源站未提供。因此,用户在解释分析结果时应保持谨慎,并结合实验背景进行验证。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议以及使用限制,源站未提供。用户在使用该数据集时,应遵循 NCBI 的一般使用条款,并建议直接访问 BioProject 记录页面(ID 1446736)以获取最新的引用信息和任何可能的许可声明。由于源站未提供具体的引用格式或数据使用协议,用户在发表研究成果时,应自行确认是否需要获得数据提供者的授权或遵循特定的数据共享政策。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1446736

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

临床证据表明,持续性STAT3激活和脂质代谢改变与乳腺癌患者的病理进展相关,并驱动化疗耐药。在此,我们证明H2S——一种内源性气体信号分子——通过抑制STAT3信号介导的脂质代谢使乳腺癌对化疗敏感,并改善肿瘤免疫原性。此外,我们进一步鉴定Ni2+可作为强效金属免疫治疗的免疫激动剂。可激活纳米平台的构建实现了金属离子和H2S气体的可控递送,从而触发细胞焦亡并动员多种免疫细胞,与化疗联合激发系统性抗肿瘤免疫。此外,与alphaPD-1的协同作用可抑制原发性和转移性肿瘤的进展。我们的工作凸显了生物活性气体递质和营养金属离子在逆转乳腺癌化疗耐药和低免疫原性双重困境方面的潜力,从而提供了一种与多种临床治疗模式协同的纳米增敏策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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