STAT3干扰驱动的纳米调节剂逆转乳腺癌脂质代谢相关化疗耐药并增强金属免疫治疗_雌性Balb/c小鼠4T1乳腺肿瘤组织,DOX化疗后

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1446327),收录雌性 Balb/c 小鼠经 DOX 化疗后 4T1 乳腺肿瘤组织的原始测序读段

sra
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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1446327: STAT3 interference-driven nanomodulators reverse lipid metabolism-associated chemoresistance and potentiate metalloimmunotherapy in breast cancer_4T1 breast tumor tissues of female Balb/c mice, after DOX chemotherapy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

STAT3干扰驱动的纳米调节剂逆转乳腺癌脂质代谢相关化疗耐药并增强金属免疫治疗_雌性Balb/c小鼠4T1乳腺肿瘤组织,DOX化疗后

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1446327,英文名称为“PRJNA1446327: STAT3 interference-driven nanomodulators reverse lipid metabolism-associated chemoresistance and potentiate metalloimmunotherapy in breast cancer_4T1 breast tumor tissues of female Balb/c mice, after DOX chemotherapy”。从名称可以看出,该数据集围绕乳腺癌化疗耐药与金属免疫治疗相关研究,样本为雌性 Balb/c 小鼠经 DOX 化疗后的 4T1 乳腺肿瘤组织。数据集在站内归入肿瘤 / 乳腺癌分类,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,主题标签为“Raw sequence reads”,即原始测序读段。整体而言,该数据集属于 NCBI BioProject 体系下与单一研究计划相关的生物学数据集合,可供用户集中查找该项目产生的特定数据类型。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式,用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据。按照源站描述,一个 BioProject 记录来自单一机构或联盟,并为用户提供一个统一入口,以便找到该项目所产生的多种数据类型。编号 1446327 即对应这样一个项目记录。该项目的标题指向 STAT3 干扰驱动的纳米调节剂、脂质代谢相关化疗耐药、金属免疫治疗以及乳腺癌等研究主题,并明确涉及雌性 Bal/c 小鼠经 DOX 化疗后的 4T1 乳腺肿瘤组织。本站将其归入肿瘤 / 乳腺癌分类,说明其内容与乳腺癌研究场景相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其收录的数据类型为原始测序读段。结合数据集名称,这些读段应来自雌性 Balb/c 小鼠经 DOX 化疗后的 4T1 乳腺肿瘤组织。除上述信息外,源站未提供关于读段长度、测序平台、样本数量、数据量、文件格式或具体分析结果的进一步说明。因此,无法从现有信息判断其测序策略、覆盖深度或是否包含对照样本。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject,源站标题为“ID 1446327 - BioProject - NCBI”,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。样本背景为雌性 Balb/c 小鼠的 4T1 乳腺肿瘤组织,且这些组织是在 DOX 化疗之后获取。关于样本采集时间、处理流程、伦理审批信息、具体实验条件以及测序建库方法,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于与乳腺癌化疗耐药、脂质代谢、STAT3 干扰、纳米调节剂以及金属免疫治疗相关的原始测序读段层面的检索与再利用。由于主题标签为原始测序读段,其潜在用途包括重新分析测序数据、开展转录组或其他基于读段的探索性研究,以及围绕 4T1 乳腺肿瘤模型和 DOX 化疗背景进行方法学比较。但具体适用性取决于用户对测序类型、样本设计和数据质量的判断,而这些细节源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1446327 查找该项目,并借助 BioProject 提供的链接入口访问与之关联的数据类型。由于该记录本身是项目层面的集合,具体数据下载方式、文件组织结构和分析流程需依据 NCBI 页面上的实际链接进行操作。源站未提供针对该数据集的专门使用说明、代码或分析指南。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共数据库中的项目记录。其主题标签为原始测序读段,通常意味着数据未经充分加工或注释,使用前可能需要自行进行质量控制与预处理。关于数据质量、测序错误率、污染情况、样本完整性以及是否存在批次效应,源站未提供。此外,该数据集仅涉及雌性 Balb/c 小鼠的 4T1 乳腺肿瘤组织,且为 DOX 化疗后样本,外推到其他物种、其他肿瘤模型或其他治疗条件时需谨慎。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 1446327。关于引用方式、许可条款、数据使用限制或授权信息,源站未提供。用户在使用时应自行查阅 NCBI BioProject 页面及相关数据记录中可能附带的说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1446327

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

临床证据表明,持续性STAT3激活和脂质代谢改变与乳腺癌患者的病理进展相关,并驱动化疗耐药。在此,我们证明H2S——一种内源性气体信号分子——通过抑制STAT3信号介导的脂质代谢使乳腺癌对化疗敏感,并改善肿瘤免疫原性。此外,我们进一步鉴定Ni2+可作为强效金属免疫治疗的免疫激动剂。可激活纳米平台的构建实现了金属离子和H2S气体的可控递送,从而触发细胞焦亡并动员多种免疫细胞,与化疗联合激发系统性抗肿瘤免疫。此外,与alphaPD-1的协同作用可抑制原发性和转移性肿瘤的进展。我们的工作凸显了生物活性气体递质和营养金属离子在逆转乳腺癌化疗耐药和低免疫原性双重困境方面的潜力,从而提供了一种与多种临床治疗模式协同的纳米增敏策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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