乳腺癌脑转移细胞结构解析:预后不同的免疫景观
乳腺癌脑转移(BCBM)是一种严重疾病,对改进的个性化治疗有很高需求,但目前对 BCBM 免疫微环境异质性及免疫治疗敏感性的全面理解仍然缺乏

基本信息
资源简介
乳腺癌脑转移细胞结构解析:预后不同的免疫景观
乳腺癌脑转移(BCBM)是一种严重疾病,对改进的个性化治疗有很高需求,但目前对 BCBM 免疫微环境异质性及免疫治疗敏感性的全面理解仍然缺乏。该数据集围绕乳腺癌脑转移的细胞结构展开研究,旨在剖析其免疫微环境并揭示具有预后区分意义的免疫景观。研究对临床注释完善的 156 例 BCBM 队列进行多模态免疫微环境刻画,整合组织细胞术、bulk 与单核 RNA 测序、流式细胞术和空间转录组学,并辅以患者来源模型的功能研究。整合分析揭示了两种可预测患者生存期延长的免疫景观,且这两种景观无法从配对的原始肿瘤中推断出来。
【数据集背景】
乳腺癌脑转移(BCBM)是一种严重疾病,对改进的个性化治疗有很高需求,但目前对 BCBM 免疫微环境异质性及免疫治疗敏感性的全面理解仍然缺乏。该数据集所对应的研究正是针对这一缺口,试图通过多模态手段全面刻画 BCBM 的免疫微环境,识别与患者预后相关的免疫景观,从而为个性化治疗和免疫治疗敏感性评估提供依据。
【数据内容】
该数据集来源于一项对临床注释完善的 156 例 BCBM 队列的多模态免疫微环境研究。研究采用组织细胞术、bulk RNA 测序、单核 RNA 测序、流式细胞术以及空间转录组学等多种技术手段,并辅以患者来源模型的功能研究。整合分析揭示了两种可预测患者生存期延长的免疫景观,且这两种景观无法从配对的原始肿瘤中推断出来:其一为含有高比例 CD8+ 组织驻留样记忆 T 细胞的 BCBM,这类细胞是肿瘤免疫控制的主要参与者;其二为含有三级淋巴结构的 BCBM。这些景观的替代性特征在独立的 BCBM 中具有预后价值。源站描述在此处中断,后续内容未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据集英文名称为“PRJNA1435156: Dissecting the cellular architecture of breast cancer brain metastases reveals prognostically distinct immune landscapes”。本站分类为肿瘤 / 乳腺癌。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批及具体实验流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息,该数据集适用于乳腺癌脑转移免疫微环境异质性的研究,可用于探索与患者生存期延长相关的免疫景观,包括以 CD8+ 组织驻留样记忆 T 细胞为主要参与者的免疫控制型景观,以及含有三级淋巴结构的景观。同时,该数据集有助于研究这些免疫景观的替代性特征在独立 BCBM 队列中的预后价值,并可能为免疫治疗敏感性评估和个性化治疗策略提供参考。其他具体适用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具等信息。
【质量与限制】
该研究基于临床注释完善的 156 例 BCBM 队列,并整合了多种技术手段与患者来源模型的功能研究,具有一定的多模态数据基础。但源站描述在“Surrogate signatures of these landscapes are prognostic in independent BCBM an”处中断,后续关于独立队列验证范围、样本量及具体预后表现等信息未提供。此外,该数据集在数据质量控制、批次效应、技术平台差异等方面的具体说明,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1435156
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
乳腺癌脑转移(BCBM)是一种严重的疾病,对改进的个体化治疗有很高的需求,但目前对BCBM免疫微环境异质性及免疫治疗敏感性的全面理解仍不足。在此,我们对一个临床注释完善的156例BCBM队列的免疫微环境进行了多模态分析,应用了组织细胞术、批量及单核RNA测序、流式细胞术和空间转录组学,并在患者来源模型中进行了功能研究作为补充。整合分析揭示了两种可预测患者生存期延长的免疫景观,且这些景观无法从配对的原始肿瘤中推断出来:1)BCBM中CD8+组织驻留样记忆T细胞比例高,是肿瘤免疫控制的主要参与者。2)BCBM中含有三级淋巴结构。这些景观的替代特征在独立的BCBM和原发性乳腺癌队列中具有预后价值,与较少的转移相关,并可预测免疫治疗反应。我们的工作为BCBM中的抗肿瘤免疫提供了关键见解,并识别出具有转化相关性的新型生物标志物。总体设计:参见各系列
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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